Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HCN3Q9P1Z3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HCN3Q9P1Z3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HCN3Q9P1Z3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
HCN3Q9P1Z3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HCN3Q9P1Z3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HCN3Q9P1Z3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HCN3Q9P1Z3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HCN3Q9P1Z3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HCN3Q9P1Z3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HCN3Q9P1Z3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HCN3Q9P1Z3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HCN3Q9P1Z3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HCN3Q9P1Z3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HCN3Q9P1Z3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HCN3Q9P1Z3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HCN3Q9P1Z3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HCN3Q9P1Z3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HCN3Q9P1Z3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HCN3Q9P1Z3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HCN3Q9P1Z3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HCN3Q9P1Z3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HCN3Q9P1Z3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HCN3Q9P1Z3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HCN3Q9P1Z3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HCN3Q9P1Z3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HCN3Q9P1Z3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HCN3Q9P1Z3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HCN3Q9P1Z3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HCN3Q9P1Z3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HCN3Q9P1Z3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HCN3Q9P1Z3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
HCN3Q9P1Z3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HCN3Q9P1Z3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HCN3Q9P1Z3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HCN3Q9P1Z3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HCN3Q9P1Z3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HCN3Q9P1Z3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HCN3Q9P1Z3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HCN3Q9P1Z3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HCN3Q9P1Z3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HCN3Q9P1Z3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HCN3Q9P1Z3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HCN3Q9P1Z3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HCN3Q9P1Z3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HCN3Q9P1Z3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HCN3Q9P1Z3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HCN3Q9P1Z3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
HCN3Q9P1Z3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HCN3Q9P1Z3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HCN3Q9P1Z3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HCN3Q9P1Z3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
HCN3Q9P1Z3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
HCN3Q9P1Z3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HCN3Q9P1Z3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HCN3Q9P1Z3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HCN3Q9P1Z3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HCN3Q9P1Z3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HCN3Q9P1Z3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HCN3Q9P1Z3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HCN3Q9P1Z3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HCN3Q9P1Z3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HCN3Q9P1Z3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HCN3Q9P1Z3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HCN3Q9P1Z3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HCN3Q9P1Z3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HCN3Q9P1Z3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HCN3Q9P1Z3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
HCN3Q9P1Z3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HCN3Q9P1Z3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
HCN3Q9P1Z3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HCN3Q9P1Z3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HCN3Q9P1Z3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HCN3Q9P1Z3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HCN3Q9P1Z3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HCN3Q9P1Z3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HCN3Q9P1Z3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
HCN3Q9P1Z3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
HCN3Q9P1Z3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
HCN3Q9P1Z3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HCN3Q9P1Z3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HCN3Q9P1Z3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HCN3Q9P1Z3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HCN3Q9P1Z3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HCN3Q9P1Z3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HCN3Q9P1Z3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HCN3Q9P1Z3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HCN3Q9P1Z3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HCN3Q9P1Z3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HCN3Q9P1Z3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HCN3Q9P1Z3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HCN3Q9P1Z3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HCN3Q9P1Z3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HCN3Q9P1Z3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
HCN3Q9P1Z3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HCN3Q9P1Z3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HCN3Q9P1Z3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HCN3Q9P1Z3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HCN3Q9P1Z3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HCN3Q9P1Z3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms