Protein–RNA interactions for Protein: Q9P107

GMIP, GEM-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 970 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMIPQ9P107 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GMIPQ9P107 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GMIPQ9P107 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GMIPQ9P107 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GMIPQ9P107 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GMIPQ9P107 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GMIPQ9P107 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
GMIPQ9P107 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GMIPQ9P107 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GMIPQ9P107 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
GMIPQ9P107 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GMIPQ9P107 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GMIPQ9P107 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
GMIPQ9P107 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GMIPQ9P107 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GMIPQ9P107 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
GMIPQ9P107 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GMIPQ9P107 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GMIPQ9P107 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GMIPQ9P107 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GMIPQ9P107 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GMIPQ9P107 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GMIPQ9P107 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GMIPQ9P107 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GMIPQ9P107 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
GMIPQ9P107 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GMIPQ9P107 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GMIPQ9P107 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
GMIPQ9P107 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GMIPQ9P107 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GMIPQ9P107 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GMIPQ9P107 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GMIPQ9P107 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GMIPQ9P107 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GMIPQ9P107 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GMIPQ9P107 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GMIPQ9P107 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GMIPQ9P107 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GMIPQ9P107 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GMIPQ9P107 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GMIPQ9P107 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GMIPQ9P107 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GMIPQ9P107 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GMIPQ9P107 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GMIPQ9P107 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GMIPQ9P107 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
GMIPQ9P107 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
GMIPQ9P107 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
GMIPQ9P107 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GMIPQ9P107 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GMIPQ9P107 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GMIPQ9P107 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GMIPQ9P107 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GMIPQ9P107 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GMIPQ9P107 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GMIPQ9P107 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GMIPQ9P107 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GMIPQ9P107 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GMIPQ9P107 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GMIPQ9P107 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GMIPQ9P107 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GMIPQ9P107 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GMIPQ9P107 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GMIPQ9P107 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GMIPQ9P107 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GMIPQ9P107 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
GMIPQ9P107 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GMIPQ9P107 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GMIPQ9P107 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GMIPQ9P107 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GMIPQ9P107 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GMIPQ9P107 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GMIPQ9P107 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GMIPQ9P107 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GMIPQ9P107 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GMIPQ9P107 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GMIPQ9P107 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GMIPQ9P107 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GMIPQ9P107 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GMIPQ9P107 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GMIPQ9P107 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GMIPQ9P107 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GMIPQ9P107 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GMIPQ9P107 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GMIPQ9P107 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GMIPQ9P107 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GMIPQ9P107 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GMIPQ9P107 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GMIPQ9P107 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GMIPQ9P107 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GMIPQ9P107 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GMIPQ9P107 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GMIPQ9P107 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GMIPQ9P107 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GMIPQ9P107 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
GMIPQ9P107 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GMIPQ9P107 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GMIPQ9P107 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GMIPQ9P107 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GMIPQ9P107 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms