Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L2

MARK1, Serine/threonine-protein kinase MARK1, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARK1Q9P0L2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MARK1Q9P0L2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MARK1Q9P0L2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
MARK1Q9P0L2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
MARK1Q9P0L2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MARK1Q9P0L2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MARK1Q9P0L2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
MARK1Q9P0L2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MARK1Q9P0L2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MARK1Q9P0L2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MARK1Q9P0L2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
MARK1Q9P0L2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MARK1Q9P0L2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MARK1Q9P0L2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MARK1Q9P0L2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
MARK1Q9P0L2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MARK1Q9P0L2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MARK1Q9P0L2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
MARK1Q9P0L2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
MARK1Q9P0L2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
MARK1Q9P0L2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MARK1Q9P0L2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MARK1Q9P0L2 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MARK1Q9P0L2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MARK1Q9P0L2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MARK1Q9P0L2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MARK1Q9P0L2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MARK1Q9P0L2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MARK1Q9P0L2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MARK1Q9P0L2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
MARK1Q9P0L2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MARK1Q9P0L2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MARK1Q9P0L2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MARK1Q9P0L2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MARK1Q9P0L2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MARK1Q9P0L2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MARK1Q9P0L2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
MARK1Q9P0L2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MARK1Q9P0L2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MARK1Q9P0L2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MARK1Q9P0L2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MARK1Q9P0L2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MARK1Q9P0L2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MARK1Q9P0L2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MARK1Q9P0L2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MARK1Q9P0L2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MARK1Q9P0L2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MARK1Q9P0L2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MARK1Q9P0L2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MARK1Q9P0L2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MARK1Q9P0L2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MARK1Q9P0L2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MARK1Q9P0L2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MARK1Q9P0L2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MARK1Q9P0L2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MARK1Q9P0L2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MARK1Q9P0L2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MARK1Q9P0L2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MARK1Q9P0L2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
MARK1Q9P0L2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MARK1Q9P0L2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MARK1Q9P0L2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MARK1Q9P0L2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MARK1Q9P0L2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MARK1Q9P0L2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MARK1Q9P0L2 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MARK1Q9P0L2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MARK1Q9P0L2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MARK1Q9P0L2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MARK1Q9P0L2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MARK1Q9P0L2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MARK1Q9P0L2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MARK1Q9P0L2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MARK1Q9P0L2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
MARK1Q9P0L2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MARK1Q9P0L2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MARK1Q9P0L2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MARK1Q9P0L2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MARK1Q9P0L2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MARK1Q9P0L2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MARK1Q9P0L2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MARK1Q9P0L2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MARK1Q9P0L2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MARK1Q9P0L2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MARK1Q9P0L2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MARK1Q9P0L2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MARK1Q9P0L2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
MARK1Q9P0L2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
MARK1Q9P0L2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
MARK1Q9P0L2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MARK1Q9P0L2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
MARK1Q9P0L2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
MARK1Q9P0L2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
MARK1Q9P0L2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MARK1Q9P0L2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MARK1Q9P0L2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MARK1Q9P0L2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
MARK1Q9P0L2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MARK1Q9P0L2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MARK1Q9P0L2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms