Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0I2

EMC3, ER membrane protein complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMC3Q9P0I2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EMC3Q9P0I2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EMC3Q9P0I2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EMC3Q9P0I2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EMC3Q9P0I2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EMC3Q9P0I2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EMC3Q9P0I2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EMC3Q9P0I2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EMC3Q9P0I2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EMC3Q9P0I2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EMC3Q9P0I2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EMC3Q9P0I2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EMC3Q9P0I2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EMC3Q9P0I2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EMC3Q9P0I2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EMC3Q9P0I2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EMC3Q9P0I2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
EMC3Q9P0I2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EMC3Q9P0I2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EMC3Q9P0I2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EMC3Q9P0I2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EMC3Q9P0I2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EMC3Q9P0I2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EMC3Q9P0I2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EMC3Q9P0I2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EMC3Q9P0I2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EMC3Q9P0I2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
EMC3Q9P0I2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EMC3Q9P0I2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EMC3Q9P0I2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EMC3Q9P0I2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EMC3Q9P0I2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EMC3Q9P0I2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EMC3Q9P0I2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EMC3Q9P0I2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EMC3Q9P0I2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EMC3Q9P0I2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EMC3Q9P0I2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EMC3Q9P0I2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EMC3Q9P0I2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EMC3Q9P0I2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EMC3Q9P0I2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
EMC3Q9P0I2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EMC3Q9P0I2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EMC3Q9P0I2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EMC3Q9P0I2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EMC3Q9P0I2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EMC3Q9P0I2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
EMC3Q9P0I2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EMC3Q9P0I2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EMC3Q9P0I2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EMC3Q9P0I2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
EMC3Q9P0I2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EMC3Q9P0I2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EMC3Q9P0I2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
EMC3Q9P0I2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EMC3Q9P0I2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EMC3Q9P0I2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EMC3Q9P0I2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
EMC3Q9P0I2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EMC3Q9P0I2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EMC3Q9P0I2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EMC3Q9P0I2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EMC3Q9P0I2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EMC3Q9P0I2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EMC3Q9P0I2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EMC3Q9P0I2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EMC3Q9P0I2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EMC3Q9P0I2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EMC3Q9P0I2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EMC3Q9P0I2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EMC3Q9P0I2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
EMC3Q9P0I2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EMC3Q9P0I2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EMC3Q9P0I2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EMC3Q9P0I2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EMC3Q9P0I2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EMC3Q9P0I2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EMC3Q9P0I2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EMC3Q9P0I2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EMC3Q9P0I2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EMC3Q9P0I2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EMC3Q9P0I2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EMC3Q9P0I2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EMC3Q9P0I2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EMC3Q9P0I2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EMC3Q9P0I2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EMC3Q9P0I2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EMC3Q9P0I2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EMC3Q9P0I2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EMC3Q9P0I2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EMC3Q9P0I2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EMC3Q9P0I2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EMC3Q9P0I2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EMC3Q9P0I2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EMC3Q9P0I2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EMC3Q9P0I2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EMC3Q9P0I2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EMC3Q9P0I2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EMC3Q9P0I2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 161.7 ms