Protein–RNA interactions for Protein: Q9P003

CNIH4, Protein cornichon homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH4Q9P003 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNIH4Q9P003 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNIH4Q9P003 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNIH4Q9P003 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNIH4Q9P003 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNIH4Q9P003 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNIH4Q9P003 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNIH4Q9P003 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNIH4Q9P003 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNIH4Q9P003 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNIH4Q9P003 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNIH4Q9P003 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNIH4Q9P003 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNIH4Q9P003 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNIH4Q9P003 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNIH4Q9P003 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNIH4Q9P003 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNIH4Q9P003 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNIH4Q9P003 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNIH4Q9P003 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNIH4Q9P003 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNIH4Q9P003 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNIH4Q9P003 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNIH4Q9P003 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNIH4Q9P003 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNIH4Q9P003 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNIH4Q9P003 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNIH4Q9P003 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNIH4Q9P003 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNIH4Q9P003 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNIH4Q9P003 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNIH4Q9P003 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNIH4Q9P003 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CNIH4Q9P003 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNIH4Q9P003 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNIH4Q9P003 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CNIH4Q9P003 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNIH4Q9P003 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CNIH4Q9P003 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CNIH4Q9P003 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNIH4Q9P003 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNIH4Q9P003 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CNIH4Q9P003 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNIH4Q9P003 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNIH4Q9P003 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNIH4Q9P003 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNIH4Q9P003 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNIH4Q9P003 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNIH4Q9P003 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNIH4Q9P003 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNIH4Q9P003 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNIH4Q9P003 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNIH4Q9P003 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNIH4Q9P003 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNIH4Q9P003 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNIH4Q9P003 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNIH4Q9P003 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNIH4Q9P003 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNIH4Q9P003 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNIH4Q9P003 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNIH4Q9P003 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNIH4Q9P003 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNIH4Q9P003 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CNIH4Q9P003 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CNIH4Q9P003 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNIH4Q9P003 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNIH4Q9P003 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNIH4Q9P003 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNIH4Q9P003 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNIH4Q9P003 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNIH4Q9P003 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNIH4Q9P003 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNIH4Q9P003 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNIH4Q9P003 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNIH4Q9P003 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNIH4Q9P003 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNIH4Q9P003 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNIH4Q9P003 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNIH4Q9P003 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNIH4Q9P003 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNIH4Q9P003 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CNIH4Q9P003 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNIH4Q9P003 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNIH4Q9P003 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNIH4Q9P003 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNIH4Q9P003 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNIH4Q9P003 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNIH4Q9P003 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNIH4Q9P003 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNIH4Q9P003 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CNIH4Q9P003 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNIH4Q9P003 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNIH4Q9P003 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNIH4Q9P003 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNIH4Q9P003 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNIH4Q9P003 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNIH4Q9P003 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CNIH4Q9P003 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNIH4Q9P003 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNIH4Q9P003 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms