Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU0

FLRT3, Leucine-rich repeat transmembrane protein FLRT3, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLRT3Q9NZU0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FLRT3Q9NZU0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FLRT3Q9NZU0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FLRT3Q9NZU0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FLRT3Q9NZU0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FLRT3Q9NZU0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FLRT3Q9NZU0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FLRT3Q9NZU0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FLRT3Q9NZU0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FLRT3Q9NZU0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FLRT3Q9NZU0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FLRT3Q9NZU0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
FLRT3Q9NZU0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FLRT3Q9NZU0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FLRT3Q9NZU0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FLRT3Q9NZU0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FLRT3Q9NZU0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FLRT3Q9NZU0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FLRT3Q9NZU0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FLRT3Q9NZU0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FLRT3Q9NZU0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
FLRT3Q9NZU0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
FLRT3Q9NZU0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FLRT3Q9NZU0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FLRT3Q9NZU0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FLRT3Q9NZU0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FLRT3Q9NZU0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FLRT3Q9NZU0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FLRT3Q9NZU0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FLRT3Q9NZU0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FLRT3Q9NZU0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FLRT3Q9NZU0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FLRT3Q9NZU0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FLRT3Q9NZU0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FLRT3Q9NZU0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FLRT3Q9NZU0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FLRT3Q9NZU0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FLRT3Q9NZU0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FLRT3Q9NZU0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
FLRT3Q9NZU0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FLRT3Q9NZU0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FLRT3Q9NZU0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FLRT3Q9NZU0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FLRT3Q9NZU0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FLRT3Q9NZU0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
FLRT3Q9NZU0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FLRT3Q9NZU0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FLRT3Q9NZU0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FLRT3Q9NZU0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FLRT3Q9NZU0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FLRT3Q9NZU0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FLRT3Q9NZU0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
FLRT3Q9NZU0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FLRT3Q9NZU0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FLRT3Q9NZU0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FLRT3Q9NZU0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FLRT3Q9NZU0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FLRT3Q9NZU0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FLRT3Q9NZU0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FLRT3Q9NZU0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FLRT3Q9NZU0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FLRT3Q9NZU0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FLRT3Q9NZU0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
FLRT3Q9NZU0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FLRT3Q9NZU0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FLRT3Q9NZU0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FLRT3Q9NZU0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
FLRT3Q9NZU0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FLRT3Q9NZU0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FLRT3Q9NZU0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FLRT3Q9NZU0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FLRT3Q9NZU0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FLRT3Q9NZU0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FLRT3Q9NZU0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FLRT3Q9NZU0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FLRT3Q9NZU0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FLRT3Q9NZU0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FLRT3Q9NZU0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FLRT3Q9NZU0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FLRT3Q9NZU0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FLRT3Q9NZU0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FLRT3Q9NZU0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FLRT3Q9NZU0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FLRT3Q9NZU0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FLRT3Q9NZU0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FLRT3Q9NZU0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FLRT3Q9NZU0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FLRT3Q9NZU0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FLRT3Q9NZU0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FLRT3Q9NZU0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FLRT3Q9NZU0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FLRT3Q9NZU0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FLRT3Q9NZU0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FLRT3Q9NZU0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FLRT3Q9NZU0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FLRT3Q9NZU0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FLRT3Q9NZU0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FLRT3Q9NZU0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FLRT3Q9NZU0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FLRT3Q9NZU0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms