Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZA1

CLIC5, Chloride intracellular channel protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC5Q9NZA1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CLIC5Q9NZA1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CLIC5Q9NZA1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CLIC5Q9NZA1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CLIC5Q9NZA1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CLIC5Q9NZA1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CLIC5Q9NZA1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLIC5Q9NZA1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLIC5Q9NZA1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLIC5Q9NZA1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLIC5Q9NZA1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLIC5Q9NZA1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLIC5Q9NZA1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CLIC5Q9NZA1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLIC5Q9NZA1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLIC5Q9NZA1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLIC5Q9NZA1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLIC5Q9NZA1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLIC5Q9NZA1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CLIC5Q9NZA1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CLIC5Q9NZA1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CLIC5Q9NZA1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CLIC5Q9NZA1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLIC5Q9NZA1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CLIC5Q9NZA1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CLIC5Q9NZA1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLIC5Q9NZA1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLIC5Q9NZA1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLIC5Q9NZA1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLIC5Q9NZA1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLIC5Q9NZA1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLIC5Q9NZA1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLIC5Q9NZA1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLIC5Q9NZA1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CLIC5Q9NZA1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CLIC5Q9NZA1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CLIC5Q9NZA1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLIC5Q9NZA1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLIC5Q9NZA1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLIC5Q9NZA1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLIC5Q9NZA1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLIC5Q9NZA1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLIC5Q9NZA1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLIC5Q9NZA1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLIC5Q9NZA1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLIC5Q9NZA1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLIC5Q9NZA1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CLIC5Q9NZA1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLIC5Q9NZA1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CLIC5Q9NZA1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLIC5Q9NZA1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLIC5Q9NZA1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLIC5Q9NZA1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CLIC5Q9NZA1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLIC5Q9NZA1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLIC5Q9NZA1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLIC5Q9NZA1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLIC5Q9NZA1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CLIC5Q9NZA1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CLIC5Q9NZA1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CLIC5Q9NZA1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CLIC5Q9NZA1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CLIC5Q9NZA1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLIC5Q9NZA1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLIC5Q9NZA1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLIC5Q9NZA1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CLIC5Q9NZA1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLIC5Q9NZA1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLIC5Q9NZA1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLIC5Q9NZA1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLIC5Q9NZA1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLIC5Q9NZA1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLIC5Q9NZA1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLIC5Q9NZA1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLIC5Q9NZA1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLIC5Q9NZA1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLIC5Q9NZA1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLIC5Q9NZA1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLIC5Q9NZA1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLIC5Q9NZA1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLIC5Q9NZA1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLIC5Q9NZA1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLIC5Q9NZA1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLIC5Q9NZA1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLIC5Q9NZA1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLIC5Q9NZA1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLIC5Q9NZA1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLIC5Q9NZA1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CLIC5Q9NZA1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLIC5Q9NZA1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CLIC5Q9NZA1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLIC5Q9NZA1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLIC5Q9NZA1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CLIC5Q9NZA1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLIC5Q9NZA1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLIC5Q9NZA1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLIC5Q9NZA1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLIC5Q9NZA1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLIC5Q9NZA1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLIC5Q9NZA1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms