Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ94

NLGN3, Neuroligin-3, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLGN3Q9NZ94 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NLGN3Q9NZ94 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NLGN3Q9NZ94 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NLGN3Q9NZ94 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NLGN3Q9NZ94 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NLGN3Q9NZ94 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NLGN3Q9NZ94 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NLGN3Q9NZ94 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NLGN3Q9NZ94 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NLGN3Q9NZ94 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NLGN3Q9NZ94 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NLGN3Q9NZ94 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NLGN3Q9NZ94 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NLGN3Q9NZ94 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NLGN3Q9NZ94 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NLGN3Q9NZ94 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NLGN3Q9NZ94 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NLGN3Q9NZ94 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NLGN3Q9NZ94 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NLGN3Q9NZ94 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NLGN3Q9NZ94 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NLGN3Q9NZ94 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NLGN3Q9NZ94 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NLGN3Q9NZ94 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NLGN3Q9NZ94 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NLGN3Q9NZ94 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NLGN3Q9NZ94 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NLGN3Q9NZ94 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NLGN3Q9NZ94 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NLGN3Q9NZ94 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NLGN3Q9NZ94 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NLGN3Q9NZ94 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NLGN3Q9NZ94 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NLGN3Q9NZ94 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NLGN3Q9NZ94 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NLGN3Q9NZ94 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NLGN3Q9NZ94 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NLGN3Q9NZ94 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NLGN3Q9NZ94 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NLGN3Q9NZ94 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NLGN3Q9NZ94 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NLGN3Q9NZ94 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NLGN3Q9NZ94 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NLGN3Q9NZ94 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NLGN3Q9NZ94 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NLGN3Q9NZ94 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NLGN3Q9NZ94 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NLGN3Q9NZ94 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NLGN3Q9NZ94 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NLGN3Q9NZ94 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NLGN3Q9NZ94 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NLGN3Q9NZ94 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NLGN3Q9NZ94 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NLGN3Q9NZ94 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NLGN3Q9NZ94 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NLGN3Q9NZ94 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NLGN3Q9NZ94 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NLGN3Q9NZ94 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NLGN3Q9NZ94 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NLGN3Q9NZ94 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NLGN3Q9NZ94 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NLGN3Q9NZ94 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NLGN3Q9NZ94 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NLGN3Q9NZ94 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NLGN3Q9NZ94 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NLGN3Q9NZ94 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NLGN3Q9NZ94 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NLGN3Q9NZ94 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
NLGN3Q9NZ94 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NLGN3Q9NZ94 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NLGN3Q9NZ94 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NLGN3Q9NZ94 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NLGN3Q9NZ94 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NLGN3Q9NZ94 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NLGN3Q9NZ94 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NLGN3Q9NZ94 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NLGN3Q9NZ94 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NLGN3Q9NZ94 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NLGN3Q9NZ94 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NLGN3Q9NZ94 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NLGN3Q9NZ94 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NLGN3Q9NZ94 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NLGN3Q9NZ94 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
NLGN3Q9NZ94 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NLGN3Q9NZ94 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NLGN3Q9NZ94 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NLGN3Q9NZ94 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NLGN3Q9NZ94 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NLGN3Q9NZ94 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NLGN3Q9NZ94 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NLGN3Q9NZ94 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NLGN3Q9NZ94 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NLGN3Q9NZ94 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NLGN3Q9NZ94 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NLGN3Q9NZ94 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NLGN3Q9NZ94 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NLGN3Q9NZ94 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NLGN3Q9NZ94 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NLGN3Q9NZ94 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NLGN3Q9NZ94 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms