Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY43

BARHL2, BarH-like 2 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL2Q9NY43 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
BARHL2Q9NY43 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
BARHL2Q9NY43 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
BARHL2Q9NY43 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
BARHL2Q9NY43 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
BARHL2Q9NY43 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
BARHL2Q9NY43 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
BARHL2Q9NY43 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC31.31■■■□□ 2.6
BARHL2Q9NY43 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
BARHL2Q9NY43 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
BARHL2Q9NY43 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
BARHL2Q9NY43 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
BARHL2Q9NY43 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
BARHL2Q9NY43 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
BARHL2Q9NY43 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
BARHL2Q9NY43 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
BARHL2Q9NY43 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.27■■■□□ 2.6
BARHL2Q9NY43 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.59
BARHL2Q9NY43 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
BARHL2Q9NY43 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
BARHL2Q9NY43 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
BARHL2Q9NY43 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
BARHL2Q9NY43 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
BARHL2Q9NY43 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
BARHL2Q9NY43 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
BARHL2Q9NY43 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
BARHL2Q9NY43 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
BARHL2Q9NY43 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
BARHL2Q9NY43 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
BARHL2Q9NY43 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
BARHL2Q9NY43 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
BARHL2Q9NY43 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
BARHL2Q9NY43 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
BARHL2Q9NY43 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
BARHL2Q9NY43 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
BARHL2Q9NY43 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
BARHL2Q9NY43 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC31.15■■■□□ 2.58
BARHL2Q9NY43 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
BARHL2Q9NY43 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
BARHL2Q9NY43 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
BARHL2Q9NY43 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
BARHL2Q9NY43 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
BARHL2Q9NY43 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
BARHL2Q9NY43 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
BARHL2Q9NY43 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
BARHL2Q9NY43 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
BARHL2Q9NY43 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
BARHL2Q9NY43 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
BARHL2Q9NY43 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
BARHL2Q9NY43 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
BARHL2Q9NY43 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
BARHL2Q9NY43 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
BARHL2Q9NY43 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
BARHL2Q9NY43 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
BARHL2Q9NY43 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
BARHL2Q9NY43 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
BARHL2Q9NY43 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
BARHL2Q9NY43 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
BARHL2Q9NY43 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
BARHL2Q9NY43 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
BARHL2Q9NY43 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
BARHL2Q9NY43 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
BARHL2Q9NY43 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
BARHL2Q9NY43 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
BARHL2Q9NY43 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
BARHL2Q9NY43 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
BARHL2Q9NY43 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
BARHL2Q9NY43 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
BARHL2Q9NY43 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
BARHL2Q9NY43 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
BARHL2Q9NY43 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
BARHL2Q9NY43 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
BARHL2Q9NY43 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
BARHL2Q9NY43 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
BARHL2Q9NY43 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
BARHL2Q9NY43 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
BARHL2Q9NY43 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
BARHL2Q9NY43 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
BARHL2Q9NY43 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
BARHL2Q9NY43 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
BARHL2Q9NY43 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
BARHL2Q9NY43 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
BARHL2Q9NY43 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
BARHL2Q9NY43 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
BARHL2Q9NY43 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
BARHL2Q9NY43 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
BARHL2Q9NY43 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
BARHL2Q9NY43 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
BARHL2Q9NY43 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
BARHL2Q9NY43 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
BARHL2Q9NY43 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
BARHL2Q9NY43 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
BARHL2Q9NY43 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
BARHL2Q9NY43 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
BARHL2Q9NY43 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
BARHL2Q9NY43 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
BARHL2Q9NY43 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
BARHL2Q9NY43 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
BARHL2Q9NY43 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
BARHL2Q9NY43 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms