Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXP7

GIN1, Gypsy retrotransposon integrase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIN1Q9NXP7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GIN1Q9NXP7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GIN1Q9NXP7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GIN1Q9NXP7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GIN1Q9NXP7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GIN1Q9NXP7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GIN1Q9NXP7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GIN1Q9NXP7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GIN1Q9NXP7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GIN1Q9NXP7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GIN1Q9NXP7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GIN1Q9NXP7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GIN1Q9NXP7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GIN1Q9NXP7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GIN1Q9NXP7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GIN1Q9NXP7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GIN1Q9NXP7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GIN1Q9NXP7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GIN1Q9NXP7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GIN1Q9NXP7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GIN1Q9NXP7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GIN1Q9NXP7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GIN1Q9NXP7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GIN1Q9NXP7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GIN1Q9NXP7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GIN1Q9NXP7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GIN1Q9NXP7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GIN1Q9NXP7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GIN1Q9NXP7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GIN1Q9NXP7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GIN1Q9NXP7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GIN1Q9NXP7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GIN1Q9NXP7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GIN1Q9NXP7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GIN1Q9NXP7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GIN1Q9NXP7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
GIN1Q9NXP7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GIN1Q9NXP7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GIN1Q9NXP7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GIN1Q9NXP7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GIN1Q9NXP7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GIN1Q9NXP7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GIN1Q9NXP7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GIN1Q9NXP7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GIN1Q9NXP7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GIN1Q9NXP7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GIN1Q9NXP7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GIN1Q9NXP7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GIN1Q9NXP7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GIN1Q9NXP7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GIN1Q9NXP7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GIN1Q9NXP7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GIN1Q9NXP7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GIN1Q9NXP7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GIN1Q9NXP7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GIN1Q9NXP7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
GIN1Q9NXP7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GIN1Q9NXP7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GIN1Q9NXP7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GIN1Q9NXP7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GIN1Q9NXP7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GIN1Q9NXP7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GIN1Q9NXP7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GIN1Q9NXP7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GIN1Q9NXP7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GIN1Q9NXP7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GIN1Q9NXP7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GIN1Q9NXP7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
GIN1Q9NXP7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GIN1Q9NXP7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GIN1Q9NXP7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GIN1Q9NXP7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GIN1Q9NXP7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GIN1Q9NXP7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GIN1Q9NXP7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GIN1Q9NXP7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GIN1Q9NXP7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GIN1Q9NXP7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GIN1Q9NXP7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GIN1Q9NXP7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GIN1Q9NXP7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GIN1Q9NXP7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GIN1Q9NXP7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GIN1Q9NXP7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GIN1Q9NXP7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GIN1Q9NXP7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GIN1Q9NXP7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GIN1Q9NXP7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GIN1Q9NXP7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GIN1Q9NXP7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GIN1Q9NXP7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GIN1Q9NXP7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GIN1Q9NXP7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GIN1Q9NXP7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GIN1Q9NXP7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GIN1Q9NXP7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GIN1Q9NXP7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GIN1Q9NXP7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GIN1Q9NXP7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GIN1Q9NXP7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms