Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PGPEP1Q9NXJ5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PGPEP1Q9NXJ5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PGPEP1Q9NXJ5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PGPEP1Q9NXJ5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PGPEP1Q9NXJ5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PGPEP1Q9NXJ5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PGPEP1Q9NXJ5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PGPEP1Q9NXJ5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PGPEP1Q9NXJ5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PGPEP1Q9NXJ5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PGPEP1Q9NXJ5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PGPEP1Q9NXJ5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PGPEP1Q9NXJ5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PGPEP1Q9NXJ5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PGPEP1Q9NXJ5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PGPEP1Q9NXJ5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PGPEP1Q9NXJ5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PGPEP1Q9NXJ5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PGPEP1Q9NXJ5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PGPEP1Q9NXJ5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PGPEP1Q9NXJ5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PGPEP1Q9NXJ5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PGPEP1Q9NXJ5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PGPEP1Q9NXJ5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PGPEP1Q9NXJ5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PGPEP1Q9NXJ5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PGPEP1Q9NXJ5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PGPEP1Q9NXJ5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PGPEP1Q9NXJ5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PGPEP1Q9NXJ5 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PGPEP1Q9NXJ5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PGPEP1Q9NXJ5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PGPEP1Q9NXJ5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PGPEP1Q9NXJ5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PGPEP1Q9NXJ5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PGPEP1Q9NXJ5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PGPEP1Q9NXJ5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PGPEP1Q9NXJ5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PGPEP1Q9NXJ5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PGPEP1Q9NXJ5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PGPEP1Q9NXJ5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PGPEP1Q9NXJ5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PGPEP1Q9NXJ5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PGPEP1Q9NXJ5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PGPEP1Q9NXJ5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PGPEP1Q9NXJ5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PGPEP1Q9NXJ5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PGPEP1Q9NXJ5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PGPEP1Q9NXJ5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PGPEP1Q9NXJ5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PGPEP1Q9NXJ5 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PGPEP1Q9NXJ5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PGPEP1Q9NXJ5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PGPEP1Q9NXJ5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PGPEP1Q9NXJ5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PGPEP1Q9NXJ5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PGPEP1Q9NXJ5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PGPEP1Q9NXJ5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PGPEP1Q9NXJ5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PGPEP1Q9NXJ5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PGPEP1Q9NXJ5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PGPEP1Q9NXJ5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PGPEP1Q9NXJ5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PGPEP1Q9NXJ5 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PGPEP1Q9NXJ5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PGPEP1Q9NXJ5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PGPEP1Q9NXJ5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PGPEP1Q9NXJ5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PGPEP1Q9NXJ5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PGPEP1Q9NXJ5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PGPEP1Q9NXJ5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PGPEP1Q9NXJ5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PGPEP1Q9NXJ5 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PGPEP1Q9NXJ5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PGPEP1Q9NXJ5 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PGPEP1Q9NXJ5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PGPEP1Q9NXJ5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PGPEP1Q9NXJ5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PGPEP1Q9NXJ5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PGPEP1Q9NXJ5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PGPEP1Q9NXJ5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PGPEP1Q9NXJ5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PGPEP1Q9NXJ5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PGPEP1Q9NXJ5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PGPEP1Q9NXJ5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PGPEP1Q9NXJ5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PGPEP1Q9NXJ5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PGPEP1Q9NXJ5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PGPEP1Q9NXJ5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGPEP1Q9NXJ5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGPEP1Q9NXJ5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGPEP1Q9NXJ5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGPEP1Q9NXJ5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGPEP1Q9NXJ5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGPEP1Q9NXJ5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGPEP1Q9NXJ5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms