Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG0

CNTLN, Centlein, humanhuman

Predictions only

Length 1,405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTLNQ9NXG0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.24■■■■■ 4.19
CNTLNQ9NXG0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
CNTLNQ9NXG0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC41.23■■■■■ 4.19
CNTLNQ9NXG0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC41.23■■■■■ 4.19
CNTLNQ9NXG0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC41.2■■■■■ 4.19
CNTLNQ9NXG0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
CNTLNQ9NXG0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
CNTLNQ9NXG0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC41.11■■■■■ 4.17
CNTLNQ9NXG0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC41.11■■■■■ 4.17
CNTLNQ9NXG0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
CNTLNQ9NXG0 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC41.1■■■■■ 4.17
CNTLNQ9NXG0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC41.1■■■■■ 4.17
CNTLNQ9NXG0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC41.1■■■■■ 4.17
CNTLNQ9NXG0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
CNTLNQ9NXG0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
CNTLNQ9NXG0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC41.06■■■■■ 4.16
CNTLNQ9NXG0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC41.06■■■■■ 4.16
CNTLNQ9NXG0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
CNTLNQ9NXG0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC41.02■■■■■ 4.16
CNTLNQ9NXG0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC41.02■■■■■ 4.16
CNTLNQ9NXG0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
CNTLNQ9NXG0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
CNTLNQ9NXG0 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
CNTLNQ9NXG0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
CNTLNQ9NXG0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC40.95■■■■■ 4.15
CNTLNQ9NXG0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
CNTLNQ9NXG0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
CNTLNQ9NXG0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
CNTLNQ9NXG0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC40.92■■■■■ 4.14
CNTLNQ9NXG0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
CNTLNQ9NXG0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
CNTLNQ9NXG0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC40.89■■■■■ 4.14
CNTLNQ9NXG0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC40.87■■■■■ 4.13
CNTLNQ9NXG0 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.87■■■■■ 4.13
CNTLNQ9NXG0 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
CNTLNQ9NXG0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
CNTLNQ9NXG0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
CNTLNQ9NXG0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC40.84■■■■■ 4.13
CNTLNQ9NXG0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
CNTLNQ9NXG0 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
CNTLNQ9NXG0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
CNTLNQ9NXG0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC40.82■■■■■ 4.12
CNTLNQ9NXG0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC40.81■■■■■ 4.12
CNTLNQ9NXG0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC40.8■■■■■ 4.12
CNTLNQ9NXG0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
CNTLNQ9NXG0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC40.77■■■■■ 4.12
CNTLNQ9NXG0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
CNTLNQ9NXG0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC40.76■■■■■ 4.12
CNTLNQ9NXG0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC40.76■■■■■ 4.12
CNTLNQ9NXG0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC40.76■■■■■ 4.11
CNTLNQ9NXG0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
CNTLNQ9NXG0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC40.74■■■■■ 4.11
CNTLNQ9NXG0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
CNTLNQ9NXG0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
CNTLNQ9NXG0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
CNTLNQ9NXG0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC40.73■■■■■ 4.11
CNTLNQ9NXG0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC40.73■■■■■ 4.11
CNTLNQ9NXG0 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
CNTLNQ9NXG0 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.73■■■■■ 4.11
CNTLNQ9NXG0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
CNTLNQ9NXG0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
CNTLNQ9NXG0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
CNTLNQ9NXG0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC40.67■■■■■ 4.1
CNTLNQ9NXG0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.67■■■■■ 4.1
CNTLNQ9NXG0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC40.67■■■■■ 4.1
CNTLNQ9NXG0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC40.67■■■■■ 4.1
CNTLNQ9NXG0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
CNTLNQ9NXG0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC40.64■■■■■ 4.1
CNTLNQ9NXG0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
CNTLNQ9NXG0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC40.63■■■■■ 4.09
CNTLNQ9NXG0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC40.63■■■■■ 4.09
CNTLNQ9NXG0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC40.63■■■■■ 4.09
CNTLNQ9NXG0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC40.62■■■■■ 4.09
CNTLNQ9NXG0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
CNTLNQ9NXG0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC40.59■■■■■ 4.09
CNTLNQ9NXG0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
CNTLNQ9NXG0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
CNTLNQ9NXG0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC40.52■■■■■ 4.08
CNTLNQ9NXG0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.51■■■■■ 4.08
CNTLNQ9NXG0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC40.51■■■■■ 4.08
CNTLNQ9NXG0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
CNTLNQ9NXG0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
CNTLNQ9NXG0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC40.5■■■■■ 4.07
CNTLNQ9NXG0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC40.5■■■■■ 4.07
CNTLNQ9NXG0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC40.47■■■■■ 4.07
CNTLNQ9NXG0 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC40.47■■■■■ 4.07
CNTLNQ9NXG0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
CNTLNQ9NXG0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC40.45■■■■■ 4.07
CNTLNQ9NXG0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
CNTLNQ9NXG0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
CNTLNQ9NXG0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.43■■■■■ 4.06
CNTLNQ9NXG0 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC40.43■■■■■ 4.06
CNTLNQ9NXG0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC40.42■■■■■ 4.06
CNTLNQ9NXG0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC40.4■■■■■ 4.06
CNTLNQ9NXG0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC40.39■■■■■ 4.06
CNTLNQ9NXG0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC40.39■■■■■ 4.06
CNTLNQ9NXG0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC40.39■■■■■ 4.06
CNTLNQ9NXG0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.38■■■■■ 4.05
CNTLNQ9NXG0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
CNTLNQ9NXG0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.34■■■■■ 4.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms