Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERVK13-1Q9NX77 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERVK13-1Q9NX77 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVK13-1Q9NX77 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVK13-1Q9NX77 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVK13-1Q9NX77 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVK13-1Q9NX77 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERVK13-1Q9NX77 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERVK13-1Q9NX77 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERVK13-1Q9NX77 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERVK13-1Q9NX77 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERVK13-1Q9NX77 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERVK13-1Q9NX77 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERVK13-1Q9NX77 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVK13-1Q9NX77 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERVK13-1Q9NX77 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERVK13-1Q9NX77 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERVK13-1Q9NX77 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERVK13-1Q9NX77 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERVK13-1Q9NX77 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVK13-1Q9NX77 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERVK13-1Q9NX77 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVK13-1Q9NX77 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVK13-1Q9NX77 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVK13-1Q9NX77 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVK13-1Q9NX77 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ERVK13-1Q9NX77 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERVK13-1Q9NX77 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERVK13-1Q9NX77 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVK13-1Q9NX77 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVK13-1Q9NX77 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVK13-1Q9NX77 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVK13-1Q9NX77 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVK13-1Q9NX77 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVK13-1Q9NX77 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVK13-1Q9NX77 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVK13-1Q9NX77 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVK13-1Q9NX77 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVK13-1Q9NX77 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ERVK13-1Q9NX77 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ERVK13-1Q9NX77 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERVK13-1Q9NX77 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVK13-1Q9NX77 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVK13-1Q9NX77 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVK13-1Q9NX77 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVK13-1Q9NX77 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVK13-1Q9NX77 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVK13-1Q9NX77 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVK13-1Q9NX77 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVK13-1Q9NX77 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVK13-1Q9NX77 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVK13-1Q9NX77 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVK13-1Q9NX77 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVK13-1Q9NX77 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERVK13-1Q9NX77 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVK13-1Q9NX77 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVK13-1Q9NX77 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVK13-1Q9NX77 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVK13-1Q9NX77 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVK13-1Q9NX77 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVK13-1Q9NX77 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERVK13-1Q9NX77 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERVK13-1Q9NX77 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERVK13-1Q9NX77 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERVK13-1Q9NX77 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERVK13-1Q9NX77 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERVK13-1Q9NX77 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERVK13-1Q9NX77 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERVK13-1Q9NX77 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERVK13-1Q9NX77 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ERVK13-1Q9NX77 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERVK13-1Q9NX77 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERVK13-1Q9NX77 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERVK13-1Q9NX77 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ERVK13-1Q9NX77 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ERVK13-1Q9NX77 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ERVK13-1Q9NX77 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERVK13-1Q9NX77 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVK13-1Q9NX77 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERVK13-1Q9NX77 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERVK13-1Q9NX77 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERVK13-1Q9NX77 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVK13-1Q9NX77 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVK13-1Q9NX77 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVK13-1Q9NX77 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERVK13-1Q9NX77 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERVK13-1Q9NX77 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERVK13-1Q9NX77 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERVK13-1Q9NX77 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERVK13-1Q9NX77 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERVK13-1Q9NX77 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERVK13-1Q9NX77 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERVK13-1Q9NX77 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERVK13-1Q9NX77 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERVK13-1Q9NX77 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERVK13-1Q9NX77 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERVK13-1Q9NX77 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERVK13-1Q9NX77 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ERVK13-1Q9NX77 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ERVK13-1Q9NX77 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms