Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWV4

C1orf123, UPF0587 protein C1orf123, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf123Q9NWV4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1orf123Q9NWV4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1orf123Q9NWV4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1orf123Q9NWV4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1orf123Q9NWV4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1orf123Q9NWV4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1orf123Q9NWV4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1orf123Q9NWV4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1orf123Q9NWV4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1orf123Q9NWV4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1orf123Q9NWV4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1orf123Q9NWV4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1orf123Q9NWV4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1orf123Q9NWV4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C1orf123Q9NWV4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C1orf123Q9NWV4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
C1orf123Q9NWV4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C1orf123Q9NWV4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C1orf123Q9NWV4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C1orf123Q9NWV4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1orf123Q9NWV4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1orf123Q9NWV4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1orf123Q9NWV4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1orf123Q9NWV4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C1orf123Q9NWV4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1orf123Q9NWV4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
C1orf123Q9NWV4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C1orf123Q9NWV4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C1orf123Q9NWV4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C1orf123Q9NWV4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C1orf123Q9NWV4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C1orf123Q9NWV4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C1orf123Q9NWV4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C1orf123Q9NWV4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1orf123Q9NWV4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1orf123Q9NWV4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1orf123Q9NWV4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1orf123Q9NWV4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C1orf123Q9NWV4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
C1orf123Q9NWV4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C1orf123Q9NWV4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C1orf123Q9NWV4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C1orf123Q9NWV4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C1orf123Q9NWV4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C1orf123Q9NWV4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C1orf123Q9NWV4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C1orf123Q9NWV4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C1orf123Q9NWV4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C1orf123Q9NWV4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C1orf123Q9NWV4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1orf123Q9NWV4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1orf123Q9NWV4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1orf123Q9NWV4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C1orf123Q9NWV4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C1orf123Q9NWV4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
C1orf123Q9NWV4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23■■□□□ 1.27
C1orf123Q9NWV4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C1orf123Q9NWV4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1orf123Q9NWV4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1orf123Q9NWV4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1orf123Q9NWV4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1orf123Q9NWV4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1orf123Q9NWV4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1orf123Q9NWV4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1orf123Q9NWV4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1orf123Q9NWV4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1orf123Q9NWV4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1orf123Q9NWV4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
C1orf123Q9NWV4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1orf123Q9NWV4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1orf123Q9NWV4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1orf123Q9NWV4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
C1orf123Q9NWV4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1orf123Q9NWV4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1orf123Q9NWV4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
C1orf123Q9NWV4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1orf123Q9NWV4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1orf123Q9NWV4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1orf123Q9NWV4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1orf123Q9NWV4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1orf123Q9NWV4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1orf123Q9NWV4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1orf123Q9NWV4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1orf123Q9NWV4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C1orf123Q9NWV4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C1orf123Q9NWV4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C1orf123Q9NWV4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C1orf123Q9NWV4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1orf123Q9NWV4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1orf123Q9NWV4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1orf123Q9NWV4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1orf123Q9NWV4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
C1orf123Q9NWV4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1orf123Q9NWV4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1orf123Q9NWV4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1orf123Q9NWV4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1orf123Q9NWV4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1orf123Q9NWV4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1orf123Q9NWV4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1orf123Q9NWV4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms