Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
FBXO28Q9NVF7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
FBXO28Q9NVF7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
FBXO28Q9NVF7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
FBXO28Q9NVF7 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
FBXO28Q9NVF7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
FBXO28Q9NVF7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
FBXO28Q9NVF7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
FBXO28Q9NVF7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
FBXO28Q9NVF7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
FBXO28Q9NVF7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
FBXO28Q9NVF7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
FBXO28Q9NVF7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
FBXO28Q9NVF7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
FBXO28Q9NVF7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
FBXO28Q9NVF7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
FBXO28Q9NVF7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
FBXO28Q9NVF7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
FBXO28Q9NVF7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
FBXO28Q9NVF7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
FBXO28Q9NVF7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
FBXO28Q9NVF7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
FBXO28Q9NVF7 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
FBXO28Q9NVF7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
FBXO28Q9NVF7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
FBXO28Q9NVF7 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
FBXO28Q9NVF7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
FBXO28Q9NVF7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
FBXO28Q9NVF7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
FBXO28Q9NVF7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
FBXO28Q9NVF7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
FBXO28Q9NVF7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
FBXO28Q9NVF7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
FBXO28Q9NVF7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
FBXO28Q9NVF7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
FBXO28Q9NVF7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
FBXO28Q9NVF7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
FBXO28Q9NVF7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
FBXO28Q9NVF7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
FBXO28Q9NVF7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
FBXO28Q9NVF7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
FBXO28Q9NVF7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
FBXO28Q9NVF7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
FBXO28Q9NVF7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
FBXO28Q9NVF7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
FBXO28Q9NVF7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
FBXO28Q9NVF7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
FBXO28Q9NVF7 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
FBXO28Q9NVF7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
FBXO28Q9NVF7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
FBXO28Q9NVF7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
FBXO28Q9NVF7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
FBXO28Q9NVF7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
FBXO28Q9NVF7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
FBXO28Q9NVF7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
FBXO28Q9NVF7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
FBXO28Q9NVF7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
FBXO28Q9NVF7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
FBXO28Q9NVF7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
FBXO28Q9NVF7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
FBXO28Q9NVF7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
FBXO28Q9NVF7 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
FBXO28Q9NVF7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
FBXO28Q9NVF7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
FBXO28Q9NVF7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
FBXO28Q9NVF7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
FBXO28Q9NVF7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
FBXO28Q9NVF7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
FBXO28Q9NVF7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
FBXO28Q9NVF7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
FBXO28Q9NVF7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.61
FBXO28Q9NVF7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
FBXO28Q9NVF7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
FBXO28Q9NVF7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
FBXO28Q9NVF7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
FBXO28Q9NVF7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
FBXO28Q9NVF7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
FBXO28Q9NVF7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
FBXO28Q9NVF7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
FBXO28Q9NVF7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
FBXO28Q9NVF7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
FBXO28Q9NVF7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
FBXO28Q9NVF7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
FBXO28Q9NVF7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC31.27■■■□□ 2.6
FBXO28Q9NVF7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.59
FBXO28Q9NVF7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
FBXO28Q9NVF7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
FBXO28Q9NVF7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
FBXO28Q9NVF7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
FBXO28Q9NVF7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
FBXO28Q9NVF7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
FBXO28Q9NVF7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
FBXO28Q9NVF7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
FBXO28Q9NVF7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
FBXO28Q9NVF7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
FBXO28Q9NVF7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
FBXO28Q9NVF7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
FBXO28Q9NVF7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
FBXO28Q9NVF7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
FBXO28Q9NVF7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms