Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
LMBRD1Q9NUN5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
LMBRD1Q9NUN5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
LMBRD1Q9NUN5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
LMBRD1Q9NUN5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
LMBRD1Q9NUN5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC31.48■■■□□ 2.63
LMBRD1Q9NUN5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
LMBRD1Q9NUN5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
LMBRD1Q9NUN5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
LMBRD1Q9NUN5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
LMBRD1Q9NUN5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
LMBRD1Q9NUN5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
LMBRD1Q9NUN5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
LMBRD1Q9NUN5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
LMBRD1Q9NUN5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
LMBRD1Q9NUN5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
LMBRD1Q9NUN5 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
LMBRD1Q9NUN5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
LMBRD1Q9NUN5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
LMBRD1Q9NUN5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
LMBRD1Q9NUN5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
LMBRD1Q9NUN5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
LMBRD1Q9NUN5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
LMBRD1Q9NUN5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
LMBRD1Q9NUN5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
LMBRD1Q9NUN5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
LMBRD1Q9NUN5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
LMBRD1Q9NUN5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
LMBRD1Q9NUN5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
LMBRD1Q9NUN5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
LMBRD1Q9NUN5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
LMBRD1Q9NUN5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
LMBRD1Q9NUN5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.6
LMBRD1Q9NUN5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
LMBRD1Q9NUN5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
LMBRD1Q9NUN5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
LMBRD1Q9NUN5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
LMBRD1Q9NUN5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
LMBRD1Q9NUN5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
LMBRD1Q9NUN5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
LMBRD1Q9NUN5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
LMBRD1Q9NUN5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
LMBRD1Q9NUN5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
LMBRD1Q9NUN5 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
LMBRD1Q9NUN5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
LMBRD1Q9NUN5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
LMBRD1Q9NUN5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
LMBRD1Q9NUN5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
LMBRD1Q9NUN5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
LMBRD1Q9NUN5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
LMBRD1Q9NUN5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
LMBRD1Q9NUN5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
LMBRD1Q9NUN5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
LMBRD1Q9NUN5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
LMBRD1Q9NUN5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
LMBRD1Q9NUN5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
LMBRD1Q9NUN5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC31.07■■■□□ 2.56
LMBRD1Q9NUN5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
LMBRD1Q9NUN5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
LMBRD1Q9NUN5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
LMBRD1Q9NUN5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
LMBRD1Q9NUN5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
LMBRD1Q9NUN5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
LMBRD1Q9NUN5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
LMBRD1Q9NUN5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
LMBRD1Q9NUN5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
LMBRD1Q9NUN5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
LMBRD1Q9NUN5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
LMBRD1Q9NUN5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
LMBRD1Q9NUN5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
LMBRD1Q9NUN5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
LMBRD1Q9NUN5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
LMBRD1Q9NUN5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC31.01■■■□□ 2.55
LMBRD1Q9NUN5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
LMBRD1Q9NUN5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
LMBRD1Q9NUN5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
LMBRD1Q9NUN5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
LMBRD1Q9NUN5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
LMBRD1Q9NUN5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
LMBRD1Q9NUN5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
LMBRD1Q9NUN5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
LMBRD1Q9NUN5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
LMBRD1Q9NUN5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
LMBRD1Q9NUN5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
LMBRD1Q9NUN5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
LMBRD1Q9NUN5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
LMBRD1Q9NUN5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
LMBRD1Q9NUN5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
LMBRD1Q9NUN5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
LMBRD1Q9NUN5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
LMBRD1Q9NUN5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
LMBRD1Q9NUN5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
LMBRD1Q9NUN5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
LMBRD1Q9NUN5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
LMBRD1Q9NUN5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
LMBRD1Q9NUN5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
LMBRD1Q9NUN5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
LMBRD1Q9NUN5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
LMBRD1Q9NUN5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
LMBRD1Q9NUN5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms