Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
GJB4Q9NTQ9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
GJB4Q9NTQ9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
GJB4Q9NTQ9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
GJB4Q9NTQ9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
GJB4Q9NTQ9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
GJB4Q9NTQ9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
GJB4Q9NTQ9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
GJB4Q9NTQ9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
GJB4Q9NTQ9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
GJB4Q9NTQ9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
GJB4Q9NTQ9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
GJB4Q9NTQ9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
GJB4Q9NTQ9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
GJB4Q9NTQ9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
GJB4Q9NTQ9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
GJB4Q9NTQ9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
GJB4Q9NTQ9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
GJB4Q9NTQ9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC31.38■■■□□ 2.61
GJB4Q9NTQ9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC31.38■■■□□ 2.61
GJB4Q9NTQ9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
GJB4Q9NTQ9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
GJB4Q9NTQ9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
GJB4Q9NTQ9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
GJB4Q9NTQ9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
GJB4Q9NTQ9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
GJB4Q9NTQ9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
GJB4Q9NTQ9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
GJB4Q9NTQ9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
GJB4Q9NTQ9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
GJB4Q9NTQ9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
GJB4Q9NTQ9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.26■■■□□ 2.6
GJB4Q9NTQ9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
GJB4Q9NTQ9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
GJB4Q9NTQ9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
GJB4Q9NTQ9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
GJB4Q9NTQ9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
GJB4Q9NTQ9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
GJB4Q9NTQ9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC31.2■■■□□ 2.59
GJB4Q9NTQ9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
GJB4Q9NTQ9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
GJB4Q9NTQ9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
GJB4Q9NTQ9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
GJB4Q9NTQ9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
GJB4Q9NTQ9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
GJB4Q9NTQ9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
GJB4Q9NTQ9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
GJB4Q9NTQ9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
GJB4Q9NTQ9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
GJB4Q9NTQ9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
GJB4Q9NTQ9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
GJB4Q9NTQ9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC31.17■■■□□ 2.58
GJB4Q9NTQ9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
GJB4Q9NTQ9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
GJB4Q9NTQ9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
GJB4Q9NTQ9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
GJB4Q9NTQ9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
GJB4Q9NTQ9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
GJB4Q9NTQ9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
GJB4Q9NTQ9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
GJB4Q9NTQ9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
GJB4Q9NTQ9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
GJB4Q9NTQ9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
GJB4Q9NTQ9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
GJB4Q9NTQ9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
GJB4Q9NTQ9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
GJB4Q9NTQ9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
GJB4Q9NTQ9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
GJB4Q9NTQ9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
GJB4Q9NTQ9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
GJB4Q9NTQ9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
GJB4Q9NTQ9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
GJB4Q9NTQ9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
GJB4Q9NTQ9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
GJB4Q9NTQ9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
GJB4Q9NTQ9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
GJB4Q9NTQ9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
GJB4Q9NTQ9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
GJB4Q9NTQ9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
GJB4Q9NTQ9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
GJB4Q9NTQ9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
GJB4Q9NTQ9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
GJB4Q9NTQ9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
GJB4Q9NTQ9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
GJB4Q9NTQ9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
GJB4Q9NTQ9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
GJB4Q9NTQ9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
GJB4Q9NTQ9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
GJB4Q9NTQ9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
GJB4Q9NTQ9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
GJB4Q9NTQ9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
GJB4Q9NTQ9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
GJB4Q9NTQ9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
GJB4Q9NTQ9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
GJB4Q9NTQ9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
GJB4Q9NTQ9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
GJB4Q9NTQ9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
GJB4Q9NTQ9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
GJB4Q9NTQ9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
GJB4Q9NTQ9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.3 ms