Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB4

KRT82, Keratin, type II cuticular Hb2, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT82Q9NSB4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
KRT82Q9NSB4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KRT82Q9NSB4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KRT82Q9NSB4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KRT82Q9NSB4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KRT82Q9NSB4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
KRT82Q9NSB4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KRT82Q9NSB4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
KRT82Q9NSB4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KRT82Q9NSB4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KRT82Q9NSB4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
KRT82Q9NSB4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
KRT82Q9NSB4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KRT82Q9NSB4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
KRT82Q9NSB4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
KRT82Q9NSB4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
KRT82Q9NSB4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KRT82Q9NSB4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KRT82Q9NSB4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KRT82Q9NSB4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KRT82Q9NSB4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KRT82Q9NSB4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KRT82Q9NSB4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KRT82Q9NSB4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KRT82Q9NSB4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KRT82Q9NSB4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KRT82Q9NSB4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KRT82Q9NSB4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KRT82Q9NSB4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KRT82Q9NSB4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KRT82Q9NSB4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
KRT82Q9NSB4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
KRT82Q9NSB4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
KRT82Q9NSB4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
KRT82Q9NSB4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
KRT82Q9NSB4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
KRT82Q9NSB4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
KRT82Q9NSB4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KRT82Q9NSB4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KRT82Q9NSB4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KRT82Q9NSB4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KRT82Q9NSB4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KRT82Q9NSB4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KRT82Q9NSB4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KRT82Q9NSB4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KRT82Q9NSB4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KRT82Q9NSB4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KRT82Q9NSB4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KRT82Q9NSB4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KRT82Q9NSB4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KRT82Q9NSB4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KRT82Q9NSB4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
KRT82Q9NSB4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KRT82Q9NSB4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KRT82Q9NSB4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KRT82Q9NSB4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KRT82Q9NSB4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
KRT82Q9NSB4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KRT82Q9NSB4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KRT82Q9NSB4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KRT82Q9NSB4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KRT82Q9NSB4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KRT82Q9NSB4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KRT82Q9NSB4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KRT82Q9NSB4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
KRT82Q9NSB4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KRT82Q9NSB4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KRT82Q9NSB4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KRT82Q9NSB4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KRT82Q9NSB4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KRT82Q9NSB4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
KRT82Q9NSB4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KRT82Q9NSB4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
KRT82Q9NSB4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KRT82Q9NSB4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KRT82Q9NSB4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KRT82Q9NSB4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KRT82Q9NSB4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
KRT82Q9NSB4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KRT82Q9NSB4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KRT82Q9NSB4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KRT82Q9NSB4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KRT82Q9NSB4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KRT82Q9NSB4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
KRT82Q9NSB4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KRT82Q9NSB4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KRT82Q9NSB4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KRT82Q9NSB4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
KRT82Q9NSB4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KRT82Q9NSB4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KRT82Q9NSB4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KRT82Q9NSB4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KRT82Q9NSB4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KRT82Q9NSB4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KRT82Q9NSB4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KRT82Q9NSB4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KRT82Q9NSB4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KRT82Q9NSB4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KRT82Q9NSB4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KRT82Q9NSB4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.6 ms