Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS71

GKN1, Gastrokine-1, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKN1Q9NS71 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GKN1Q9NS71 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GKN1Q9NS71 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GKN1Q9NS71 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
GKN1Q9NS71 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GKN1Q9NS71 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GKN1Q9NS71 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GKN1Q9NS71 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
GKN1Q9NS71 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GKN1Q9NS71 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GKN1Q9NS71 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GKN1Q9NS71 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GKN1Q9NS71 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
GKN1Q9NS71 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GKN1Q9NS71 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
GKN1Q9NS71 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GKN1Q9NS71 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GKN1Q9NS71 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GKN1Q9NS71 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
GKN1Q9NS71 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GKN1Q9NS71 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GKN1Q9NS71 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
GKN1Q9NS71 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GKN1Q9NS71 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GKN1Q9NS71 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GKN1Q9NS71 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GKN1Q9NS71 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GKN1Q9NS71 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GKN1Q9NS71 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GKN1Q9NS71 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GKN1Q9NS71 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GKN1Q9NS71 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GKN1Q9NS71 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GKN1Q9NS71 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GKN1Q9NS71 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
GKN1Q9NS71 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GKN1Q9NS71 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GKN1Q9NS71 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GKN1Q9NS71 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
GKN1Q9NS71 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GKN1Q9NS71 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GKN1Q9NS71 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GKN1Q9NS71 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GKN1Q9NS71 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GKN1Q9NS71 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GKN1Q9NS71 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GKN1Q9NS71 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GKN1Q9NS71 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GKN1Q9NS71 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GKN1Q9NS71 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GKN1Q9NS71 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GKN1Q9NS71 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
GKN1Q9NS71 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
GKN1Q9NS71 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GKN1Q9NS71 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GKN1Q9NS71 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GKN1Q9NS71 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GKN1Q9NS71 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
GKN1Q9NS71 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GKN1Q9NS71 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
GKN1Q9NS71 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GKN1Q9NS71 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GKN1Q9NS71 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GKN1Q9NS71 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GKN1Q9NS71 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GKN1Q9NS71 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GKN1Q9NS71 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GKN1Q9NS71 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GKN1Q9NS71 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GKN1Q9NS71 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GKN1Q9NS71 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GKN1Q9NS71 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GKN1Q9NS71 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GKN1Q9NS71 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GKN1Q9NS71 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GKN1Q9NS71 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GKN1Q9NS71 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GKN1Q9NS71 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GKN1Q9NS71 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GKN1Q9NS71 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GKN1Q9NS71 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GKN1Q9NS71 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GKN1Q9NS71 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GKN1Q9NS71 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GKN1Q9NS71 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GKN1Q9NS71 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GKN1Q9NS71 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GKN1Q9NS71 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GKN1Q9NS71 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GKN1Q9NS71 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GKN1Q9NS71 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
GKN1Q9NS71 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GKN1Q9NS71 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GKN1Q9NS71 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GKN1Q9NS71 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GKN1Q9NS71 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GKN1Q9NS71 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GKN1Q9NS71 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
GKN1Q9NS71 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GKN1Q9NS71 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms