Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRY4

ARHGAP35, Rho GTPase-activating protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP35Q9NRY4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC43.72■■■■■ 4.59
ARHGAP35Q9NRY4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC43.72■■■■■ 4.59
ARHGAP35Q9NRY4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC43.71■■■■■ 4.59
ARHGAP35Q9NRY4 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.71■■■■■ 4.59
ARHGAP35Q9NRY4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
ARHGAP35Q9NRY4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.59
ARHGAP35Q9NRY4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
ARHGAP35Q9NRY4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.66■■■■■ 4.58
ARHGAP35Q9NRY4 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
ARHGAP35Q9NRY4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
ARHGAP35Q9NRY4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.64■■■■■ 4.58
ARHGAP35Q9NRY4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC43.64■■■■■ 4.58
ARHGAP35Q9NRY4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.57
ARHGAP35Q9NRY4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC43.61■■■■■ 4.57
ARHGAP35Q9NRY4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.6■■■■■ 4.57
ARHGAP35Q9NRY4 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
ARHGAP35Q9NRY4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
ARHGAP35Q9NRY4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
ARHGAP35Q9NRY4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.57■■■■■ 4.56
ARHGAP35Q9NRY4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC43.57■■■■■ 4.56
ARHGAP35Q9NRY4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.56■■■■■ 4.56
ARHGAP35Q9NRY4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
ARHGAP35Q9NRY4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.55■■■■■ 4.56
ARHGAP35Q9NRY4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
ARHGAP35Q9NRY4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC43.52■■■■■ 4.56
ARHGAP35Q9NRY4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC43.52■■■■■ 4.56
ARHGAP35Q9NRY4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC43.52■■■■■ 4.56
ARHGAP35Q9NRY4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC43.51■■■■■ 4.56
ARHGAP35Q9NRY4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
ARHGAP35Q9NRY4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
ARHGAP35Q9NRY4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.5■■■■■ 4.55
ARHGAP35Q9NRY4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
ARHGAP35Q9NRY4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC43.48■■■■■ 4.55
ARHGAP35Q9NRY4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
ARHGAP35Q9NRY4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
ARHGAP35Q9NRY4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC43.46■■■■■ 4.55
ARHGAP35Q9NRY4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
ARHGAP35Q9NRY4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC43.45■■■■■ 4.55
ARHGAP35Q9NRY4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.55
ARHGAP35Q9NRY4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
ARHGAP35Q9NRY4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC43.4■■■■■ 4.54
ARHGAP35Q9NRY4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
ARHGAP35Q9NRY4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC43.4■■■■■ 4.54
ARHGAP35Q9NRY4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
ARHGAP35Q9NRY4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.53
ARHGAP35Q9NRY4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC43.36■■■■■ 4.53
ARHGAP35Q9NRY4 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
ARHGAP35Q9NRY4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
ARHGAP35Q9NRY4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
ARHGAP35Q9NRY4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
ARHGAP35Q9NRY4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
ARHGAP35Q9NRY4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
ARHGAP35Q9NRY4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
ARHGAP35Q9NRY4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC43.26■■■■■ 4.52
ARHGAP35Q9NRY4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC43.26■■■■■ 4.52
ARHGAP35Q9NRY4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC43.26■■■■■ 4.52
ARHGAP35Q9NRY4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
ARHGAP35Q9NRY4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
ARHGAP35Q9NRY4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
ARHGAP35Q9NRY4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
ARHGAP35Q9NRY4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
ARHGAP35Q9NRY4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
ARHGAP35Q9NRY4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC43.22■■■■■ 4.51
ARHGAP35Q9NRY4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC43.22■■■■■ 4.51
ARHGAP35Q9NRY4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC43.22■■■■■ 4.51
ARHGAP35Q9NRY4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.21■■■■■ 4.51
ARHGAP35Q9NRY4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.21■■■■■ 4.51
ARHGAP35Q9NRY4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
ARHGAP35Q9NRY4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.51
ARHGAP35Q9NRY4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC43.19■■■■■ 4.51
ARHGAP35Q9NRY4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC43.19■■■■■ 4.5
ARHGAP35Q9NRY4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC43.18■■■■■ 4.5
ARHGAP35Q9NRY4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
ARHGAP35Q9NRY4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
ARHGAP35Q9NRY4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
ARHGAP35Q9NRY4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
ARHGAP35Q9NRY4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.15■■■■■ 4.5
ARHGAP35Q9NRY4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC43.14■■■■■ 4.5
ARHGAP35Q9NRY4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.13■■■■■ 4.49
ARHGAP35Q9NRY4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
ARHGAP35Q9NRY4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC43.12■■■■■ 4.49
ARHGAP35Q9NRY4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC43.1■■■■■ 4.49
ARHGAP35Q9NRY4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC43.1■■■■■ 4.49
ARHGAP35Q9NRY4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
ARHGAP35Q9NRY4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC43.09■■■■■ 4.49
ARHGAP35Q9NRY4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
ARHGAP35Q9NRY4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.49
ARHGAP35Q9NRY4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.49
ARHGAP35Q9NRY4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC43.07■■■■■ 4.49
ARHGAP35Q9NRY4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.49
ARHGAP35Q9NRY4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
ARHGAP35Q9NRY4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
ARHGAP35Q9NRY4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
ARHGAP35Q9NRY4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC43.05■■■■■ 4.48
ARHGAP35Q9NRY4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
ARHGAP35Q9NRY4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
ARHGAP35Q9NRY4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC43.02■■■■■ 4.48
ARHGAP35Q9NRY4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC43.02■■■■■ 4.48
ARHGAP35Q9NRY4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC43.02■■■■■ 4.48
ARHGAP35Q9NRY4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms