Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF8

CTPS2, CTP synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS2Q9NRF8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTPS2Q9NRF8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTPS2Q9NRF8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CTPS2Q9NRF8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTPS2Q9NRF8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTPS2Q9NRF8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTPS2Q9NRF8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTPS2Q9NRF8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTPS2Q9NRF8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTPS2Q9NRF8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTPS2Q9NRF8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTPS2Q9NRF8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTPS2Q9NRF8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTPS2Q9NRF8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTPS2Q9NRF8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTPS2Q9NRF8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTPS2Q9NRF8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTPS2Q9NRF8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTPS2Q9NRF8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CTPS2Q9NRF8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTPS2Q9NRF8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTPS2Q9NRF8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTPS2Q9NRF8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTPS2Q9NRF8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTPS2Q9NRF8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTPS2Q9NRF8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTPS2Q9NRF8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTPS2Q9NRF8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTPS2Q9NRF8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTPS2Q9NRF8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTPS2Q9NRF8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTPS2Q9NRF8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTPS2Q9NRF8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTPS2Q9NRF8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTPS2Q9NRF8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTPS2Q9NRF8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTPS2Q9NRF8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTPS2Q9NRF8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTPS2Q9NRF8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTPS2Q9NRF8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTPS2Q9NRF8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTPS2Q9NRF8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTPS2Q9NRF8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTPS2Q9NRF8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTPS2Q9NRF8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTPS2Q9NRF8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTPS2Q9NRF8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTPS2Q9NRF8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTPS2Q9NRF8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTPS2Q9NRF8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTPS2Q9NRF8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTPS2Q9NRF8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CTPS2Q9NRF8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTPS2Q9NRF8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTPS2Q9NRF8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTPS2Q9NRF8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTPS2Q9NRF8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTPS2Q9NRF8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CTPS2Q9NRF8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTPS2Q9NRF8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTPS2Q9NRF8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTPS2Q9NRF8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTPS2Q9NRF8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTPS2Q9NRF8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTPS2Q9NRF8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTPS2Q9NRF8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CTPS2Q9NRF8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTPS2Q9NRF8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTPS2Q9NRF8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTPS2Q9NRF8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTPS2Q9NRF8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CTPS2Q9NRF8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTPS2Q9NRF8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTPS2Q9NRF8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTPS2Q9NRF8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTPS2Q9NRF8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTPS2Q9NRF8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTPS2Q9NRF8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTPS2Q9NRF8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTPS2Q9NRF8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTPS2Q9NRF8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CTPS2Q9NRF8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTPS2Q9NRF8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTPS2Q9NRF8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTPS2Q9NRF8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CTPS2Q9NRF8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTPS2Q9NRF8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTPS2Q9NRF8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTPS2Q9NRF8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTPS2Q9NRF8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTPS2Q9NRF8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTPS2Q9NRF8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTPS2Q9NRF8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTPS2Q9NRF8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTPS2Q9NRF8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTPS2Q9NRF8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTPS2Q9NRF8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTPS2Q9NRF8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTPS2Q9NRF8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTPS2Q9NRF8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.2 ms