Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD0

FBXO8, F-box only protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO8Q9NRD0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FBXO8Q9NRD0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FBXO8Q9NRD0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FBXO8Q9NRD0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FBXO8Q9NRD0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FBXO8Q9NRD0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FBXO8Q9NRD0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
FBXO8Q9NRD0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FBXO8Q9NRD0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FBXO8Q9NRD0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FBXO8Q9NRD0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FBXO8Q9NRD0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
FBXO8Q9NRD0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FBXO8Q9NRD0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FBXO8Q9NRD0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FBXO8Q9NRD0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FBXO8Q9NRD0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FBXO8Q9NRD0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FBXO8Q9NRD0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FBXO8Q9NRD0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FBXO8Q9NRD0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
FBXO8Q9NRD0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FBXO8Q9NRD0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FBXO8Q9NRD0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FBXO8Q9NRD0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FBXO8Q9NRD0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FBXO8Q9NRD0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FBXO8Q9NRD0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FBXO8Q9NRD0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FBXO8Q9NRD0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
FBXO8Q9NRD0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FBXO8Q9NRD0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
FBXO8Q9NRD0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
FBXO8Q9NRD0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FBXO8Q9NRD0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FBXO8Q9NRD0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FBXO8Q9NRD0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FBXO8Q9NRD0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FBXO8Q9NRD0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FBXO8Q9NRD0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FBXO8Q9NRD0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FBXO8Q9NRD0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FBXO8Q9NRD0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FBXO8Q9NRD0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FBXO8Q9NRD0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
FBXO8Q9NRD0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FBXO8Q9NRD0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FBXO8Q9NRD0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FBXO8Q9NRD0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FBXO8Q9NRD0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FBXO8Q9NRD0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FBXO8Q9NRD0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FBXO8Q9NRD0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FBXO8Q9NRD0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FBXO8Q9NRD0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FBXO8Q9NRD0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FBXO8Q9NRD0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FBXO8Q9NRD0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FBXO8Q9NRD0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FBXO8Q9NRD0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FBXO8Q9NRD0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
FBXO8Q9NRD0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FBXO8Q9NRD0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FBXO8Q9NRD0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FBXO8Q9NRD0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FBXO8Q9NRD0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FBXO8Q9NRD0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FBXO8Q9NRD0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FBXO8Q9NRD0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FBXO8Q9NRD0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FBXO8Q9NRD0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FBXO8Q9NRD0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FBXO8Q9NRD0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FBXO8Q9NRD0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FBXO8Q9NRD0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FBXO8Q9NRD0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
FBXO8Q9NRD0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FBXO8Q9NRD0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FBXO8Q9NRD0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FBXO8Q9NRD0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FBXO8Q9NRD0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FBXO8Q9NRD0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FBXO8Q9NRD0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FBXO8Q9NRD0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FBXO8Q9NRD0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
FBXO8Q9NRD0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FBXO8Q9NRD0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FBXO8Q9NRD0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FBXO8Q9NRD0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FBXO8Q9NRD0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FBXO8Q9NRD0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FBXO8Q9NRD0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FBXO8Q9NRD0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FBXO8Q9NRD0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FBXO8Q9NRD0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FBXO8Q9NRD0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FBXO8Q9NRD0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FBXO8Q9NRD0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FBXO8Q9NRD0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FBXO8Q9NRD0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms