Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR80

ARHGEF4, Rho guanine nucleotide exchange factor 4, humanhuman

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Length 690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF4Q9NR80 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARHGEF4Q9NR80 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARHGEF4Q9NR80 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARHGEF4Q9NR80 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARHGEF4Q9NR80 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARHGEF4Q9NR80 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARHGEF4Q9NR80 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARHGEF4Q9NR80 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARHGEF4Q9NR80 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARHGEF4Q9NR80 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARHGEF4Q9NR80 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARHGEF4Q9NR80 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARHGEF4Q9NR80 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ARHGEF4Q9NR80 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ARHGEF4Q9NR80 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ARHGEF4Q9NR80 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ARHGEF4Q9NR80 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ARHGEF4Q9NR80 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARHGEF4Q9NR80 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
ARHGEF4Q9NR80 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARHGEF4Q9NR80 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARHGEF4Q9NR80 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ARHGEF4Q9NR80 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ARHGEF4Q9NR80 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ARHGEF4Q9NR80 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ARHGEF4Q9NR80 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ARHGEF4Q9NR80 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ARHGEF4Q9NR80 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ARHGEF4Q9NR80 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARHGEF4Q9NR80 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARHGEF4Q9NR80 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
ARHGEF4Q9NR80 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
ARHGEF4Q9NR80 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARHGEF4Q9NR80 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARHGEF4Q9NR80 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARHGEF4Q9NR80 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARHGEF4Q9NR80 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARHGEF4Q9NR80 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ARHGEF4Q9NR80 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.33■■■□□ 2.12
ARHGEF4Q9NR80 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ARHGEF4Q9NR80 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ARHGEF4Q9NR80 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ARHGEF4Q9NR80 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ARHGEF4Q9NR80 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ARHGEF4Q9NR80 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARHGEF4Q9NR80 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARHGEF4Q9NR80 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARHGEF4Q9NR80 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARHGEF4Q9NR80 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARHGEF4Q9NR80 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARHGEF4Q9NR80 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
ARHGEF4Q9NR80 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ARHGEF4Q9NR80 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ARHGEF4Q9NR80 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ARHGEF4Q9NR80 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ARHGEF4Q9NR80 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ARHGEF4Q9NR80 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARHGEF4Q9NR80 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARHGEF4Q9NR80 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARHGEF4Q9NR80 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARHGEF4Q9NR80 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARHGEF4Q9NR80 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARHGEF4Q9NR80 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARHGEF4Q9NR80 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARHGEF4Q9NR80 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARHGEF4Q9NR80 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ARHGEF4Q9NR80 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARHGEF4Q9NR80 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARHGEF4Q9NR80 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
ARHGEF4Q9NR80 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARHGEF4Q9NR80 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARHGEF4Q9NR80 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARHGEF4Q9NR80 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARHGEF4Q9NR80 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARHGEF4Q9NR80 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ARHGEF4Q9NR80 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARHGEF4Q9NR80 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARHGEF4Q9NR80 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARHGEF4Q9NR80 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARHGEF4Q9NR80 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
ARHGEF4Q9NR80 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARHGEF4Q9NR80 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARHGEF4Q9NR80 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARHGEF4Q9NR80 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARHGEF4Q9NR80 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARHGEF4Q9NR80 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARHGEF4Q9NR80 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARHGEF4Q9NR80 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARHGEF4Q9NR80 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGEF4Q9NR80 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ARHGEF4Q9NR80 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARHGEF4Q9NR80 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARHGEF4Q9NR80 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARHGEF4Q9NR80 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARHGEF4Q9NR80 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARHGEF4Q9NR80 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARHGEF4Q9NR80 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
ARHGEF4Q9NR80 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
ARHGEF4Q9NR80 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ARHGEF4Q9NR80 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
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