Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR19

ACSS2, Acetyl-coenzyme A synthetase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSS2Q9NR19 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ACSS2Q9NR19 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ACSS2Q9NR19 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ACSS2Q9NR19 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ACSS2Q9NR19 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ACSS2Q9NR19 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ACSS2Q9NR19 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ACSS2Q9NR19 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ACSS2Q9NR19 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ACSS2Q9NR19 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ACSS2Q9NR19 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ACSS2Q9NR19 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ACSS2Q9NR19 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ACSS2Q9NR19 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ACSS2Q9NR19 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ACSS2Q9NR19 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ACSS2Q9NR19 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ACSS2Q9NR19 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ACSS2Q9NR19 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ACSS2Q9NR19 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ACSS2Q9NR19 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ACSS2Q9NR19 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ACSS2Q9NR19 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ACSS2Q9NR19 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ACSS2Q9NR19 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ACSS2Q9NR19 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ACSS2Q9NR19 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ACSS2Q9NR19 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ACSS2Q9NR19 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ACSS2Q9NR19 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ACSS2Q9NR19 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ACSS2Q9NR19 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ACSS2Q9NR19 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ACSS2Q9NR19 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ACSS2Q9NR19 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ACSS2Q9NR19 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ACSS2Q9NR19 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ACSS2Q9NR19 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ACSS2Q9NR19 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ACSS2Q9NR19 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ACSS2Q9NR19 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ACSS2Q9NR19 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ACSS2Q9NR19 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ACSS2Q9NR19 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ACSS2Q9NR19 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ACSS2Q9NR19 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ACSS2Q9NR19 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ACSS2Q9NR19 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ACSS2Q9NR19 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ACSS2Q9NR19 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ACSS2Q9NR19 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ACSS2Q9NR19 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
ACSS2Q9NR19 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ACSS2Q9NR19 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
ACSS2Q9NR19 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
ACSS2Q9NR19 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ACSS2Q9NR19 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ACSS2Q9NR19 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ACSS2Q9NR19 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ACSS2Q9NR19 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ACSS2Q9NR19 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ACSS2Q9NR19 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ACSS2Q9NR19 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ACSS2Q9NR19 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ACSS2Q9NR19 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ACSS2Q9NR19 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ACSS2Q9NR19 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ACSS2Q9NR19 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ACSS2Q9NR19 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ACSS2Q9NR19 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ACSS2Q9NR19 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ACSS2Q9NR19 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ACSS2Q9NR19 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ACSS2Q9NR19 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ACSS2Q9NR19 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ACSS2Q9NR19 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ACSS2Q9NR19 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ACSS2Q9NR19 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ACSS2Q9NR19 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ACSS2Q9NR19 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ACSS2Q9NR19 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ACSS2Q9NR19 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ACSS2Q9NR19 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ACSS2Q9NR19 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ACSS2Q9NR19 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ACSS2Q9NR19 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ACSS2Q9NR19 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ACSS2Q9NR19 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ACSS2Q9NR19 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ACSS2Q9NR19 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ACSS2Q9NR19 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ACSS2Q9NR19 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ACSS2Q9NR19 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ACSS2Q9NR19 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ACSS2Q9NR19 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ACSS2Q9NR19 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ACSS2Q9NR19 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ACSS2Q9NR19 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ACSS2Q9NR19 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ACSS2Q9NR19 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms