Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV6

PRDM10, PR domain zinc finger protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM10Q9NQV6 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
PRDM10Q9NQV6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
PRDM10Q9NQV6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PRDM10Q9NQV6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
PRDM10Q9NQV6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
PRDM10Q9NQV6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
PRDM10Q9NQV6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
PRDM10Q9NQV6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
PRDM10Q9NQV6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PRDM10Q9NQV6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PRDM10Q9NQV6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
PRDM10Q9NQV6 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
PRDM10Q9NQV6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
PRDM10Q9NQV6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
PRDM10Q9NQV6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
PRDM10Q9NQV6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
PRDM10Q9NQV6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PRDM10Q9NQV6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
PRDM10Q9NQV6 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
PRDM10Q9NQV6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PRDM10Q9NQV6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
PRDM10Q9NQV6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC32.44■■■□□ 2.78
PRDM10Q9NQV6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
PRDM10Q9NQV6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PRDM10Q9NQV6 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
PRDM10Q9NQV6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
PRDM10Q9NQV6 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
PRDM10Q9NQV6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC32.42■■■□□ 2.78
PRDM10Q9NQV6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
PRDM10Q9NQV6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
PRDM10Q9NQV6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
PRDM10Q9NQV6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PRDM10Q9NQV6 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
PRDM10Q9NQV6 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
PRDM10Q9NQV6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PRDM10Q9NQV6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
PRDM10Q9NQV6 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
PRDM10Q9NQV6 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
PRDM10Q9NQV6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC32.37■■■□□ 2.77
PRDM10Q9NQV6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
PRDM10Q9NQV6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PRDM10Q9NQV6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
PRDM10Q9NQV6 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PRDM10Q9NQV6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PRDM10Q9NQV6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
PRDM10Q9NQV6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PRDM10Q9NQV6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
PRDM10Q9NQV6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PRDM10Q9NQV6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PRDM10Q9NQV6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
PRDM10Q9NQV6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
PRDM10Q9NQV6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
PRDM10Q9NQV6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
PRDM10Q9NQV6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
PRDM10Q9NQV6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PRDM10Q9NQV6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PRDM10Q9NQV6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PRDM10Q9NQV6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PRDM10Q9NQV6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PRDM10Q9NQV6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC32.22■■■□□ 2.75
PRDM10Q9NQV6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PRDM10Q9NQV6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PRDM10Q9NQV6 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PRDM10Q9NQV6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
PRDM10Q9NQV6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
PRDM10Q9NQV6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
PRDM10Q9NQV6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
PRDM10Q9NQV6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
PRDM10Q9NQV6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PRDM10Q9NQV6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PRDM10Q9NQV6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PRDM10Q9NQV6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PRDM10Q9NQV6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PRDM10Q9NQV6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PRDM10Q9NQV6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PRDM10Q9NQV6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PRDM10Q9NQV6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PRDM10Q9NQV6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PRDM10Q9NQV6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
PRDM10Q9NQV6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PRDM10Q9NQV6 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PRDM10Q9NQV6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
PRDM10Q9NQV6 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PRDM10Q9NQV6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
PRDM10Q9NQV6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PRDM10Q9NQV6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PRDM10Q9NQV6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PRDM10Q9NQV6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PRDM10Q9NQV6 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PRDM10Q9NQV6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PRDM10Q9NQV6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PRDM10Q9NQV6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PRDM10Q9NQV6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PRDM10Q9NQV6 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PRDM10Q9NQV6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
PRDM10Q9NQV6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
PRDM10Q9NQV6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PRDM10Q9NQV6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PRDM10Q9NQV6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
PRDM10Q9NQV6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms