Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ50

MRPL40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL40Q9NQ50 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
MRPL40Q9NQ50 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MRPL40Q9NQ50 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MRPL40Q9NQ50 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MRPL40Q9NQ50 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MRPL40Q9NQ50 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MRPL40Q9NQ50 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MRPL40Q9NQ50 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MRPL40Q9NQ50 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MRPL40Q9NQ50 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MRPL40Q9NQ50 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MRPL40Q9NQ50 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MRPL40Q9NQ50 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MRPL40Q9NQ50 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MRPL40Q9NQ50 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MRPL40Q9NQ50 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MRPL40Q9NQ50 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MRPL40Q9NQ50 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MRPL40Q9NQ50 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MRPL40Q9NQ50 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MRPL40Q9NQ50 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MRPL40Q9NQ50 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MRPL40Q9NQ50 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MRPL40Q9NQ50 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MRPL40Q9NQ50 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MRPL40Q9NQ50 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MRPL40Q9NQ50 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MRPL40Q9NQ50 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MRPL40Q9NQ50 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MRPL40Q9NQ50 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MRPL40Q9NQ50 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MRPL40Q9NQ50 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MRPL40Q9NQ50 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MRPL40Q9NQ50 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MRPL40Q9NQ50 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MRPL40Q9NQ50 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MRPL40Q9NQ50 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MRPL40Q9NQ50 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
MRPL40Q9NQ50 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
MRPL40Q9NQ50 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MRPL40Q9NQ50 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MRPL40Q9NQ50 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MRPL40Q9NQ50 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MRPL40Q9NQ50 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MRPL40Q9NQ50 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MRPL40Q9NQ50 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MRPL40Q9NQ50 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MRPL40Q9NQ50 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MRPL40Q9NQ50 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MRPL40Q9NQ50 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MRPL40Q9NQ50 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MRPL40Q9NQ50 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MRPL40Q9NQ50 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MRPL40Q9NQ50 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MRPL40Q9NQ50 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MRPL40Q9NQ50 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MRPL40Q9NQ50 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MRPL40Q9NQ50 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
MRPL40Q9NQ50 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
MRPL40Q9NQ50 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MRPL40Q9NQ50 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
MRPL40Q9NQ50 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MRPL40Q9NQ50 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MRPL40Q9NQ50 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MRPL40Q9NQ50 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MRPL40Q9NQ50 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MRPL40Q9NQ50 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MRPL40Q9NQ50 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
MRPL40Q9NQ50 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MRPL40Q9NQ50 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MRPL40Q9NQ50 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MRPL40Q9NQ50 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MRPL40Q9NQ50 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MRPL40Q9NQ50 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MRPL40Q9NQ50 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MRPL40Q9NQ50 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MRPL40Q9NQ50 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
MRPL40Q9NQ50 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MRPL40Q9NQ50 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MRPL40Q9NQ50 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MRPL40Q9NQ50 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MRPL40Q9NQ50 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
MRPL40Q9NQ50 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MRPL40Q9NQ50 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MRPL40Q9NQ50 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MRPL40Q9NQ50 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MRPL40Q9NQ50 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MRPL40Q9NQ50 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MRPL40Q9NQ50 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MRPL40Q9NQ50 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MRPL40Q9NQ50 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MRPL40Q9NQ50 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MRPL40Q9NQ50 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MRPL40Q9NQ50 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MRPL40Q9NQ50 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
MRPL40Q9NQ50 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MRPL40Q9NQ50 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
MRPL40Q9NQ50 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MRPL40Q9NQ50 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MRPL40Q9NQ50 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.7 ms