Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPF2

CHST11, Carbohydrate sulfotransferase 11, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST11Q9NPF2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHST11Q9NPF2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHST11Q9NPF2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHST11Q9NPF2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CHST11Q9NPF2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CHST11Q9NPF2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHST11Q9NPF2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHST11Q9NPF2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHST11Q9NPF2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHST11Q9NPF2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHST11Q9NPF2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHST11Q9NPF2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CHST11Q9NPF2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHST11Q9NPF2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHST11Q9NPF2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHST11Q9NPF2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHST11Q9NPF2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHST11Q9NPF2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHST11Q9NPF2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHST11Q9NPF2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHST11Q9NPF2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHST11Q9NPF2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHST11Q9NPF2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHST11Q9NPF2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHST11Q9NPF2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CHST11Q9NPF2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHST11Q9NPF2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHST11Q9NPF2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHST11Q9NPF2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHST11Q9NPF2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHST11Q9NPF2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHST11Q9NPF2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHST11Q9NPF2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CHST11Q9NPF2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHST11Q9NPF2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHST11Q9NPF2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHST11Q9NPF2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHST11Q9NPF2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHST11Q9NPF2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHST11Q9NPF2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHST11Q9NPF2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHST11Q9NPF2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHST11Q9NPF2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHST11Q9NPF2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHST11Q9NPF2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHST11Q9NPF2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHST11Q9NPF2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHST11Q9NPF2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHST11Q9NPF2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHST11Q9NPF2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHST11Q9NPF2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHST11Q9NPF2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHST11Q9NPF2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHST11Q9NPF2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHST11Q9NPF2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHST11Q9NPF2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHST11Q9NPF2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CHST11Q9NPF2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHST11Q9NPF2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CHST11Q9NPF2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHST11Q9NPF2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CHST11Q9NPF2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHST11Q9NPF2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHST11Q9NPF2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHST11Q9NPF2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHST11Q9NPF2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHST11Q9NPF2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHST11Q9NPF2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHST11Q9NPF2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHST11Q9NPF2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHST11Q9NPF2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHST11Q9NPF2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHST11Q9NPF2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHST11Q9NPF2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHST11Q9NPF2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHST11Q9NPF2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHST11Q9NPF2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHST11Q9NPF2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHST11Q9NPF2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CHST11Q9NPF2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHST11Q9NPF2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHST11Q9NPF2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHST11Q9NPF2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CHST11Q9NPF2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHST11Q9NPF2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CHST11Q9NPF2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHST11Q9NPF2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHST11Q9NPF2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHST11Q9NPF2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHST11Q9NPF2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHST11Q9NPF2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHST11Q9NPF2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHST11Q9NPF2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHST11Q9NPF2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHST11Q9NPF2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHST11Q9NPF2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHST11Q9NPF2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHST11Q9NPF2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHST11Q9NPF2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHST11Q9NPF2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms