Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP84

TNFRSF12A, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 12A, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF12AQ9NP84 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNFRSF12AQ9NP84 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNFRSF12AQ9NP84 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TNFRSF12AQ9NP84 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNFRSF12AQ9NP84 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNFRSF12AQ9NP84 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNFRSF12AQ9NP84 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNFRSF12AQ9NP84 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNFRSF12AQ9NP84 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNFRSF12AQ9NP84 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNFRSF12AQ9NP84 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TNFRSF12AQ9NP84 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNFRSF12AQ9NP84 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNFRSF12AQ9NP84 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNFRSF12AQ9NP84 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TNFRSF12AQ9NP84 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNFRSF12AQ9NP84 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNFRSF12AQ9NP84 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNFRSF12AQ9NP84 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNFRSF12AQ9NP84 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNFRSF12AQ9NP84 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNFRSF12AQ9NP84 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNFRSF12AQ9NP84 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNFRSF12AQ9NP84 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNFRSF12AQ9NP84 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNFRSF12AQ9NP84 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNFRSF12AQ9NP84 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNFRSF12AQ9NP84 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNFRSF12AQ9NP84 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TNFRSF12AQ9NP84 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNFRSF12AQ9NP84 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNFRSF12AQ9NP84 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNFRSF12AQ9NP84 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNFRSF12AQ9NP84 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
TNFRSF12AQ9NP84 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNFRSF12AQ9NP84 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNFRSF12AQ9NP84 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNFRSF12AQ9NP84 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNFRSF12AQ9NP84 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNFRSF12AQ9NP84 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TNFRSF12AQ9NP84 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNFRSF12AQ9NP84 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TNFRSF12AQ9NP84 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TNFRSF12AQ9NP84 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNFRSF12AQ9NP84 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNFRSF12AQ9NP84 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
TNFRSF12AQ9NP84 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNFRSF12AQ9NP84 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNFRSF12AQ9NP84 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNFRSF12AQ9NP84 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNFRSF12AQ9NP84 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNFRSF12AQ9NP84 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNFRSF12AQ9NP84 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNFRSF12AQ9NP84 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TNFRSF12AQ9NP84 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNFRSF12AQ9NP84 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNFRSF12AQ9NP84 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNFRSF12AQ9NP84 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNFRSF12AQ9NP84 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TNFRSF12AQ9NP84 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TNFRSF12AQ9NP84 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TNFRSF12AQ9NP84 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TNFRSF12AQ9NP84 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNFRSF12AQ9NP84 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNFRSF12AQ9NP84 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNFRSF12AQ9NP84 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNFRSF12AQ9NP84 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNFRSF12AQ9NP84 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNFRSF12AQ9NP84 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNFRSF12AQ9NP84 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNFRSF12AQ9NP84 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNFRSF12AQ9NP84 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNFRSF12AQ9NP84 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNFRSF12AQ9NP84 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNFRSF12AQ9NP84 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNFRSF12AQ9NP84 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNFRSF12AQ9NP84 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNFRSF12AQ9NP84 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TNFRSF12AQ9NP84 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNFRSF12AQ9NP84 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNFRSF12AQ9NP84 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNFRSF12AQ9NP84 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNFRSF12AQ9NP84 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNFRSF12AQ9NP84 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNFRSF12AQ9NP84 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNFRSF12AQ9NP84 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNFRSF12AQ9NP84 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNFRSF12AQ9NP84 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNFRSF12AQ9NP84 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNFRSF12AQ9NP84 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNFRSF12AQ9NP84 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNFRSF12AQ9NP84 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNFRSF12AQ9NP84 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNFRSF12AQ9NP84 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNFRSF12AQ9NP84 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNFRSF12AQ9NP84 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNFRSF12AQ9NP84 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNFRSF12AQ9NP84 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNFRSF12AQ9NP84 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNFRSF12AQ9NP84 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms