Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP78

ABCB9, ATP-binding cassette sub-family B member 9, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB9Q9NP78 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCB9Q9NP78 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCB9Q9NP78 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCB9Q9NP78 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCB9Q9NP78 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCB9Q9NP78 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCB9Q9NP78 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCB9Q9NP78 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCB9Q9NP78 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCB9Q9NP78 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCB9Q9NP78 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCB9Q9NP78 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ABCB9Q9NP78 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ABCB9Q9NP78 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCB9Q9NP78 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCB9Q9NP78 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCB9Q9NP78 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCB9Q9NP78 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCB9Q9NP78 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCB9Q9NP78 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCB9Q9NP78 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ABCB9Q9NP78 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCB9Q9NP78 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCB9Q9NP78 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCB9Q9NP78 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCB9Q9NP78 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCB9Q9NP78 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCB9Q9NP78 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCB9Q9NP78 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCB9Q9NP78 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCB9Q9NP78 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCB9Q9NP78 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCB9Q9NP78 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCB9Q9NP78 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCB9Q9NP78 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCB9Q9NP78 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCB9Q9NP78 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCB9Q9NP78 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCB9Q9NP78 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCB9Q9NP78 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCB9Q9NP78 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCB9Q9NP78 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ABCB9Q9NP78 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ABCB9Q9NP78 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ABCB9Q9NP78 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ABCB9Q9NP78 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCB9Q9NP78 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCB9Q9NP78 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCB9Q9NP78 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ABCB9Q9NP78 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ABCB9Q9NP78 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ABCB9Q9NP78 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ABCB9Q9NP78 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ABCB9Q9NP78 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ABCB9Q9NP78 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ABCB9Q9NP78 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ABCB9Q9NP78 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ABCB9Q9NP78 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ABCB9Q9NP78 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ABCB9Q9NP78 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ABCB9Q9NP78 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ABCB9Q9NP78 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ABCB9Q9NP78 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ABCB9Q9NP78 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ABCB9Q9NP78 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCB9Q9NP78 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCB9Q9NP78 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCB9Q9NP78 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCB9Q9NP78 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCB9Q9NP78 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCB9Q9NP78 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ABCB9Q9NP78 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ABCB9Q9NP78 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ABCB9Q9NP78 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ABCB9Q9NP78 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ABCB9Q9NP78 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ABCB9Q9NP78 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ABCB9Q9NP78 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ABCB9Q9NP78 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABCB9Q9NP78 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABCB9Q9NP78 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABCB9Q9NP78 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABCB9Q9NP78 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCB9Q9NP78 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCB9Q9NP78 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCB9Q9NP78 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCB9Q9NP78 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCB9Q9NP78 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCB9Q9NP78 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCB9Q9NP78 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCB9Q9NP78 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ABCB9Q9NP78 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ABCB9Q9NP78 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ABCB9Q9NP78 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ABCB9Q9NP78 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ABCB9Q9NP78 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ABCB9Q9NP78 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ABCB9Q9NP78 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ABCB9Q9NP78 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ABCB9Q9NP78 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms