Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SrfQ9JM73 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SrfQ9JM73 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SrfQ9JM73 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SrfQ9JM73 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SrfQ9JM73 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SrfQ9JM73 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SrfQ9JM73 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SrfQ9JM73 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SrfQ9JM73 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SrfQ9JM73 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SrfQ9JM73 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SrfQ9JM73 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SrfQ9JM73 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SrfQ9JM73 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SrfQ9JM73 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SrfQ9JM73 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SrfQ9JM73 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SrfQ9JM73 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SrfQ9JM73 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SrfQ9JM73 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SrfQ9JM73 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SrfQ9JM73 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SrfQ9JM73 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SrfQ9JM73 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SrfQ9JM73 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SrfQ9JM73 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SrfQ9JM73 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SrfQ9JM73 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SrfQ9JM73 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SrfQ9JM73 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SrfQ9JM73 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SrfQ9JM73 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SrfQ9JM73 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SrfQ9JM73 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SrfQ9JM73 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SrfQ9JM73 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SrfQ9JM73 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SrfQ9JM73 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SrfQ9JM73 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SrfQ9JM73 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SrfQ9JM73 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SrfQ9JM73 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SrfQ9JM73 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SrfQ9JM73 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SrfQ9JM73 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SrfQ9JM73 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SrfQ9JM73 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SrfQ9JM73 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SrfQ9JM73 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SrfQ9JM73 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SrfQ9JM73 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SrfQ9JM73 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SrfQ9JM73 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SrfQ9JM73 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SrfQ9JM73 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SrfQ9JM73 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SrfQ9JM73 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SrfQ9JM73 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SrfQ9JM73 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SrfQ9JM73 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SrfQ9JM73 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SrfQ9JM73 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SrfQ9JM73 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SrfQ9JM73 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SrfQ9JM73 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SrfQ9JM73 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SrfQ9JM73 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SrfQ9JM73 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SrfQ9JM73 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SrfQ9JM73 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SrfQ9JM73 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SrfQ9JM73 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SrfQ9JM73 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SrfQ9JM73 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SrfQ9JM73 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SrfQ9JM73 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SrfQ9JM73 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SrfQ9JM73 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SrfQ9JM73 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SrfQ9JM73 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SrfQ9JM73 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SrfQ9JM73 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SrfQ9JM73 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SrfQ9JM73 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SrfQ9JM73 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SrfQ9JM73 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SrfQ9JM73 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SrfQ9JM73 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SrfQ9JM73 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SrfQ9JM73 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SrfQ9JM73 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SrfQ9JM73 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SrfQ9JM73 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SrfQ9JM73 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SrfQ9JM73 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SrfQ9JM73 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SrfQ9JM73 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SrfQ9JM73 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SrfQ9JM73 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms