Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rabgef1Q9JM13 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Rabgef1Q9JM13 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rabgef1Q9JM13 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rabgef1Q9JM13 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rabgef1Q9JM13 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rabgef1Q9JM13 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rabgef1Q9JM13 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rabgef1Q9JM13 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rabgef1Q9JM13 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rabgef1Q9JM13 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rabgef1Q9JM13 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rabgef1Q9JM13 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Rabgef1Q9JM13 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rabgef1Q9JM13 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rabgef1Q9JM13 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rabgef1Q9JM13 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rabgef1Q9JM13 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rabgef1Q9JM13 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rabgef1Q9JM13 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rabgef1Q9JM13 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rabgef1Q9JM13 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rabgef1Q9JM13 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rabgef1Q9JM13 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rabgef1Q9JM13 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rabgef1Q9JM13 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rabgef1Q9JM13 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rabgef1Q9JM13 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rabgef1Q9JM13 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rabgef1Q9JM13 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Rabgef1Q9JM13 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rabgef1Q9JM13 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rabgef1Q9JM13 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rabgef1Q9JM13 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rabgef1Q9JM13 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rabgef1Q9JM13 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Rabgef1Q9JM13 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rabgef1Q9JM13 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rabgef1Q9JM13 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Rabgef1Q9JM13 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rabgef1Q9JM13 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rabgef1Q9JM13 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rabgef1Q9JM13 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rabgef1Q9JM13 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rabgef1Q9JM13 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rabgef1Q9JM13 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Rabgef1Q9JM13 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rabgef1Q9JM13 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rabgef1Q9JM13 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rabgef1Q9JM13 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Rabgef1Q9JM13 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rabgef1Q9JM13 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rabgef1Q9JM13 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rabgef1Q9JM13 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rabgef1Q9JM13 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rabgef1Q9JM13 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rabgef1Q9JM13 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rabgef1Q9JM13 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rabgef1Q9JM13 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rabgef1Q9JM13 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rabgef1Q9JM13 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Rabgef1Q9JM13 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rabgef1Q9JM13 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rabgef1Q9JM13 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rabgef1Q9JM13 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rabgef1Q9JM13 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rabgef1Q9JM13 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rabgef1Q9JM13 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rabgef1Q9JM13 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rabgef1Q9JM13 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rabgef1Q9JM13 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rabgef1Q9JM13 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rabgef1Q9JM13 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Rabgef1Q9JM13 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rabgef1Q9JM13 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rabgef1Q9JM13 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rabgef1Q9JM13 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rabgef1Q9JM13 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rabgef1Q9JM13 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rabgef1Q9JM13 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rabgef1Q9JM13 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rabgef1Q9JM13 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rabgef1Q9JM13 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rabgef1Q9JM13 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rabgef1Q9JM13 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rabgef1Q9JM13 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rabgef1Q9JM13 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rabgef1Q9JM13 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rabgef1Q9JM13 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rabgef1Q9JM13 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rabgef1Q9JM13 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rabgef1Q9JM13 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rabgef1Q9JM13 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rabgef1Q9JM13 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Rabgef1Q9JM13 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rabgef1Q9JM13 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rabgef1Q9JM13 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rabgef1Q9JM13 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
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