Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Col5a3Q9JLI2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Col5a3Q9JLI2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Col5a3Q9JLI2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Col5a3Q9JLI2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Col5a3Q9JLI2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Col5a3Q9JLI2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Col5a3Q9JLI2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Col5a3Q9JLI2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Col5a3Q9JLI2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Col5a3Q9JLI2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Col5a3Q9JLI2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
Col5a3Q9JLI2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Col5a3Q9JLI2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Col5a3Q9JLI2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Col5a3Q9JLI2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Col5a3Q9JLI2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Col5a3Q9JLI2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Col5a3Q9JLI2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Col5a3Q9JLI2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Col5a3Q9JLI2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Col5a3Q9JLI2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Col5a3Q9JLI2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Col5a3Q9JLI2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Col5a3Q9JLI2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Col5a3Q9JLI2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Col5a3Q9JLI2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Col5a3Q9JLI2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Col5a3Q9JLI2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Col5a3Q9JLI2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Col5a3Q9JLI2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Col5a3Q9JLI2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Col5a3Q9JLI2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Col5a3Q9JLI2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Col5a3Q9JLI2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Col5a3Q9JLI2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Col5a3Q9JLI2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Col5a3Q9JLI2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Col5a3Q9JLI2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Col5a3Q9JLI2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Col5a3Q9JLI2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Col5a3Q9JLI2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Col5a3Q9JLI2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Col5a3Q9JLI2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Col5a3Q9JLI2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Col5a3Q9JLI2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Col5a3Q9JLI2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Col5a3Q9JLI2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Col5a3Q9JLI2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Col5a3Q9JLI2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Col5a3Q9JLI2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Col5a3Q9JLI2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Col5a3Q9JLI2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Col5a3Q9JLI2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Col5a3Q9JLI2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Col5a3Q9JLI2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Col5a3Q9JLI2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Col5a3Q9JLI2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Col5a3Q9JLI2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Col5a3Q9JLI2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Col5a3Q9JLI2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Col5a3Q9JLI2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Col5a3Q9JLI2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Col5a3Q9JLI2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Col5a3Q9JLI2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Col5a3Q9JLI2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Col5a3Q9JLI2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Col5a3Q9JLI2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Col5a3Q9JLI2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Col5a3Q9JLI2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Col5a3Q9JLI2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Col5a3Q9JLI2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Col5a3Q9JLI2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Col5a3Q9JLI2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Col5a3Q9JLI2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Col5a3Q9JLI2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Col5a3Q9JLI2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Col5a3Q9JLI2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Col5a3Q9JLI2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Col5a3Q9JLI2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Col5a3Q9JLI2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Col5a3Q9JLI2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Col5a3Q9JLI2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Col5a3Q9JLI2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Col5a3Q9JLI2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Col5a3Q9JLI2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Col5a3Q9JLI2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Col5a3Q9JLI2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Col5a3Q9JLI2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Col5a3Q9JLI2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Col5a3Q9JLI2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Col5a3Q9JLI2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Col5a3Q9JLI2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Col5a3Q9JLI2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Col5a3Q9JLI2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
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