Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gfra4Q9JJT2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gfra4Q9JJT2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gfra4Q9JJT2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gfra4Q9JJT2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gfra4Q9JJT2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Gfra4Q9JJT2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gfra4Q9JJT2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gfra4Q9JJT2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gfra4Q9JJT2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gfra4Q9JJT2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gfra4Q9JJT2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gfra4Q9JJT2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gfra4Q9JJT2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gfra4Q9JJT2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gfra4Q9JJT2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gfra4Q9JJT2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Gfra4Q9JJT2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gfra4Q9JJT2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Gfra4Q9JJT2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gfra4Q9JJT2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Gfra4Q9JJT2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Gfra4Q9JJT2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Gfra4Q9JJT2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gfra4Q9JJT2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Gfra4Q9JJT2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gfra4Q9JJT2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gfra4Q9JJT2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gfra4Q9JJT2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gfra4Q9JJT2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gfra4Q9JJT2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gfra4Q9JJT2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gfra4Q9JJT2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gfra4Q9JJT2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gfra4Q9JJT2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gfra4Q9JJT2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gfra4Q9JJT2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gfra4Q9JJT2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gfra4Q9JJT2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gfra4Q9JJT2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gfra4Q9JJT2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Gfra4Q9JJT2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gfra4Q9JJT2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gfra4Q9JJT2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Gfra4Q9JJT2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Gfra4Q9JJT2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gfra4Q9JJT2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gfra4Q9JJT2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gfra4Q9JJT2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gfra4Q9JJT2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Gfra4Q9JJT2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Gfra4Q9JJT2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Gfra4Q9JJT2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gfra4Q9JJT2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gfra4Q9JJT2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gfra4Q9JJT2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gfra4Q9JJT2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Gfra4Q9JJT2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Gfra4Q9JJT2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gfra4Q9JJT2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gfra4Q9JJT2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gfra4Q9JJT2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gfra4Q9JJT2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gfra4Q9JJT2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gfra4Q9JJT2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gfra4Q9JJT2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gfra4Q9JJT2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gfra4Q9JJT2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gfra4Q9JJT2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gfra4Q9JJT2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gfra4Q9JJT2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gfra4Q9JJT2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gfra4Q9JJT2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gfra4Q9JJT2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gfra4Q9JJT2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Gfra4Q9JJT2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gfra4Q9JJT2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gfra4Q9JJT2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gfra4Q9JJT2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gfra4Q9JJT2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gfra4Q9JJT2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gfra4Q9JJT2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gfra4Q9JJT2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gfra4Q9JJT2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gfra4Q9JJT2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gfra4Q9JJT2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gfra4Q9JJT2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gfra4Q9JJT2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gfra4Q9JJT2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gfra4Q9JJT2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gfra4Q9JJT2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gfra4Q9JJT2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Gfra4Q9JJT2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gfra4Q9JJT2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gfra4Q9JJT2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gfra4Q9JJT2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gfra4Q9JJT2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gfra4Q9JJT2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gfra4Q9JJT2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gfra4Q9JJT2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms