Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN6

Ctnnbip1, Beta-catenin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbip1Q9JJN6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctnnbip1Q9JJN6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctnnbip1Q9JJN6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctnnbip1Q9JJN6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctnnbip1Q9JJN6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctnnbip1Q9JJN6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ctnnbip1Q9JJN6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ctnnbip1Q9JJN6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctnnbip1Q9JJN6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctnnbip1Q9JJN6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctnnbip1Q9JJN6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctnnbip1Q9JJN6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctnnbip1Q9JJN6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctnnbip1Q9JJN6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Ctnnbip1Q9JJN6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ctnnbip1Q9JJN6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ctnnbip1Q9JJN6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Ctnnbip1Q9JJN6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ctnnbip1Q9JJN6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ctnnbip1Q9JJN6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ctnnbip1Q9JJN6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ctnnbip1Q9JJN6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ctnnbip1Q9JJN6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ctnnbip1Q9JJN6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ctnnbip1Q9JJN6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ctnnbip1Q9JJN6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ctnnbip1Q9JJN6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ctnnbip1Q9JJN6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ctnnbip1Q9JJN6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ctnnbip1Q9JJN6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ctnnbip1Q9JJN6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ctnnbip1Q9JJN6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ctnnbip1Q9JJN6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ctnnbip1Q9JJN6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ctnnbip1Q9JJN6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ctnnbip1Q9JJN6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ctnnbip1Q9JJN6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Ctnnbip1Q9JJN6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ctnnbip1Q9JJN6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ctnnbip1Q9JJN6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ctnnbip1Q9JJN6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ctnnbip1Q9JJN6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ctnnbip1Q9JJN6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ctnnbip1Q9JJN6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ctnnbip1Q9JJN6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ctnnbip1Q9JJN6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ctnnbip1Q9JJN6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ctnnbip1Q9JJN6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ctnnbip1Q9JJN6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ctnnbip1Q9JJN6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ctnnbip1Q9JJN6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ctnnbip1Q9JJN6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ctnnbip1Q9JJN6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ctnnbip1Q9JJN6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctnnbip1Q9JJN6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctnnbip1Q9JJN6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctnnbip1Q9JJN6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctnnbip1Q9JJN6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctnnbip1Q9JJN6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctnnbip1Q9JJN6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ctnnbip1Q9JJN6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ctnnbip1Q9JJN6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ctnnbip1Q9JJN6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ctnnbip1Q9JJN6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ctnnbip1Q9JJN6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ctnnbip1Q9JJN6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ctnnbip1Q9JJN6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ctnnbip1Q9JJN6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ctnnbip1Q9JJN6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ctnnbip1Q9JJN6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ctnnbip1Q9JJN6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ctnnbip1Q9JJN6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ctnnbip1Q9JJN6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ctnnbip1Q9JJN6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ctnnbip1Q9JJN6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ctnnbip1Q9JJN6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ctnnbip1Q9JJN6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ctnnbip1Q9JJN6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ctnnbip1Q9JJN6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ctnnbip1Q9JJN6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ctnnbip1Q9JJN6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ctnnbip1Q9JJN6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ctnnbip1Q9JJN6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ctnnbip1Q9JJN6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ctnnbip1Q9JJN6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ctnnbip1Q9JJN6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ctnnbip1Q9JJN6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctnnbip1Q9JJN6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctnnbip1Q9JJN6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctnnbip1Q9JJN6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctnnbip1Q9JJN6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctnnbip1Q9JJN6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctnnbip1Q9JJN6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctnnbip1Q9JJN6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.7 ms