Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHI0

Mmp19, Matrix metalloproteinase-19, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp19Q9JHI0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mmp19Q9JHI0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mmp19Q9JHI0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mmp19Q9JHI0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mmp19Q9JHI0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mmp19Q9JHI0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mmp19Q9JHI0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mmp19Q9JHI0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mmp19Q9JHI0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Mmp19Q9JHI0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mmp19Q9JHI0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mmp19Q9JHI0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mmp19Q9JHI0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mmp19Q9JHI0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mmp19Q9JHI0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mmp19Q9JHI0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mmp19Q9JHI0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mmp19Q9JHI0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mmp19Q9JHI0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mmp19Q9JHI0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Mmp19Q9JHI0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mmp19Q9JHI0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Mmp19Q9JHI0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mmp19Q9JHI0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mmp19Q9JHI0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mmp19Q9JHI0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mmp19Q9JHI0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mmp19Q9JHI0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mmp19Q9JHI0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Mmp19Q9JHI0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mmp19Q9JHI0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mmp19Q9JHI0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mmp19Q9JHI0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mmp19Q9JHI0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Mmp19Q9JHI0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mmp19Q9JHI0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mmp19Q9JHI0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mmp19Q9JHI0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mmp19Q9JHI0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Mmp19Q9JHI0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Mmp19Q9JHI0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mmp19Q9JHI0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mmp19Q9JHI0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mmp19Q9JHI0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mmp19Q9JHI0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mmp19Q9JHI0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mmp19Q9JHI0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mmp19Q9JHI0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mmp19Q9JHI0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mmp19Q9JHI0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mmp19Q9JHI0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mmp19Q9JHI0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mmp19Q9JHI0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mmp19Q9JHI0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mmp19Q9JHI0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mmp19Q9JHI0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mmp19Q9JHI0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mmp19Q9JHI0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mmp19Q9JHI0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mmp19Q9JHI0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mmp19Q9JHI0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mmp19Q9JHI0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mmp19Q9JHI0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Mmp19Q9JHI0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mmp19Q9JHI0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mmp19Q9JHI0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mmp19Q9JHI0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mmp19Q9JHI0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mmp19Q9JHI0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mmp19Q9JHI0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mmp19Q9JHI0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mmp19Q9JHI0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mmp19Q9JHI0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mmp19Q9JHI0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mmp19Q9JHI0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mmp19Q9JHI0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mmp19Q9JHI0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mmp19Q9JHI0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mmp19Q9JHI0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mmp19Q9JHI0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mmp19Q9JHI0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mmp19Q9JHI0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mmp19Q9JHI0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mmp19Q9JHI0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Mmp19Q9JHI0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Mmp19Q9JHI0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mmp19Q9JHI0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mmp19Q9JHI0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mmp19Q9JHI0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mmp19Q9JHI0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mmp19Q9JHI0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mmp19Q9JHI0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mmp19Q9JHI0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mmp19Q9JHI0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mmp19Q9JHI0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mmp19Q9JHI0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mmp19Q9JHI0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Mmp19Q9JHI0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Mmp19Q9JHI0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mmp19Q9JHI0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms