Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD15

SRA1, Steroid receptor RNA activator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRA1Q9HD15 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRA1Q9HD15 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRA1Q9HD15 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRA1Q9HD15 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
SRA1Q9HD15 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRA1Q9HD15 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRA1Q9HD15 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRA1Q9HD15 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRA1Q9HD15 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRA1Q9HD15 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRA1Q9HD15 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRA1Q9HD15 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRA1Q9HD15 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRA1Q9HD15 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRA1Q9HD15 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRA1Q9HD15 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRA1Q9HD15 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRA1Q9HD15 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRA1Q9HD15 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRA1Q9HD15 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRA1Q9HD15 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRA1Q9HD15 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRA1Q9HD15 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRA1Q9HD15 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRA1Q9HD15 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRA1Q9HD15 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRA1Q9HD15 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRA1Q9HD15 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRA1Q9HD15 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRA1Q9HD15 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRA1Q9HD15 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRA1Q9HD15 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRA1Q9HD15 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SRA1Q9HD15 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRA1Q9HD15 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRA1Q9HD15 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRA1Q9HD15 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SRA1Q9HD15 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRA1Q9HD15 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRA1Q9HD15 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRA1Q9HD15 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRA1Q9HD15 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRA1Q9HD15 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRA1Q9HD15 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRA1Q9HD15 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRA1Q9HD15 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRA1Q9HD15 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRA1Q9HD15 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SRA1Q9HD15 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SRA1Q9HD15 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SRA1Q9HD15 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SRA1Q9HD15 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SRA1Q9HD15 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SRA1Q9HD15 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRA1Q9HD15 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRA1Q9HD15 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRA1Q9HD15 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRA1Q9HD15 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRA1Q9HD15 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRA1Q9HD15 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRA1Q9HD15 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRA1Q9HD15 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRA1Q9HD15 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRA1Q9HD15 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRA1Q9HD15 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRA1Q9HD15 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRA1Q9HD15 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRA1Q9HD15 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRA1Q9HD15 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRA1Q9HD15 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRA1Q9HD15 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRA1Q9HD15 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SRA1Q9HD15 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRA1Q9HD15 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRA1Q9HD15 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRA1Q9HD15 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRA1Q9HD15 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRA1Q9HD15 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRA1Q9HD15 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRA1Q9HD15 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRA1Q9HD15 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SRA1Q9HD15 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SRA1Q9HD15 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRA1Q9HD15 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRA1Q9HD15 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRA1Q9HD15 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRA1Q9HD15 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRA1Q9HD15 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRA1Q9HD15 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRA1Q9HD15 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRA1Q9HD15 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRA1Q9HD15 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRA1Q9HD15 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SRA1Q9HD15 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRA1Q9HD15 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRA1Q9HD15 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRA1Q9HD15 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRA1Q9HD15 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRA1Q9HD15 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRA1Q9HD15 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms