Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU8

POLD4, DNA polymerase delta subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD4Q9HCU8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
POLD4Q9HCU8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
POLD4Q9HCU8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
POLD4Q9HCU8 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
POLD4Q9HCU8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
POLD4Q9HCU8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
POLD4Q9HCU8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
POLD4Q9HCU8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
POLD4Q9HCU8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
POLD4Q9HCU8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
POLD4Q9HCU8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
POLD4Q9HCU8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
POLD4Q9HCU8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
POLD4Q9HCU8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
POLD4Q9HCU8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
POLD4Q9HCU8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
POLD4Q9HCU8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
POLD4Q9HCU8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
POLD4Q9HCU8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
POLD4Q9HCU8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
POLD4Q9HCU8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
POLD4Q9HCU8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
POLD4Q9HCU8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
POLD4Q9HCU8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
POLD4Q9HCU8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
POLD4Q9HCU8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
POLD4Q9HCU8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
POLD4Q9HCU8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
POLD4Q9HCU8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
POLD4Q9HCU8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
POLD4Q9HCU8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
POLD4Q9HCU8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
POLD4Q9HCU8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
POLD4Q9HCU8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
POLD4Q9HCU8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
POLD4Q9HCU8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
POLD4Q9HCU8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
POLD4Q9HCU8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
POLD4Q9HCU8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
POLD4Q9HCU8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
POLD4Q9HCU8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
POLD4Q9HCU8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
POLD4Q9HCU8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
POLD4Q9HCU8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
POLD4Q9HCU8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
POLD4Q9HCU8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
POLD4Q9HCU8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
POLD4Q9HCU8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
POLD4Q9HCU8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
POLD4Q9HCU8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
POLD4Q9HCU8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
POLD4Q9HCU8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
POLD4Q9HCU8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
POLD4Q9HCU8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
POLD4Q9HCU8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
POLD4Q9HCU8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
POLD4Q9HCU8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
POLD4Q9HCU8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
POLD4Q9HCU8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
POLD4Q9HCU8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
POLD4Q9HCU8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
POLD4Q9HCU8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
POLD4Q9HCU8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
POLD4Q9HCU8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
POLD4Q9HCU8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
POLD4Q9HCU8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
POLD4Q9HCU8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
POLD4Q9HCU8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
POLD4Q9HCU8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
POLD4Q9HCU8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
POLD4Q9HCU8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
POLD4Q9HCU8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
POLD4Q9HCU8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
POLD4Q9HCU8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
POLD4Q9HCU8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
POLD4Q9HCU8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
POLD4Q9HCU8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
POLD4Q9HCU8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
POLD4Q9HCU8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
POLD4Q9HCU8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
POLD4Q9HCU8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
POLD4Q9HCU8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
POLD4Q9HCU8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
POLD4Q9HCU8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
POLD4Q9HCU8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
POLD4Q9HCU8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
POLD4Q9HCU8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
POLD4Q9HCU8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
POLD4Q9HCU8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
POLD4Q9HCU8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
POLD4Q9HCU8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
POLD4Q9HCU8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
POLD4Q9HCU8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
POLD4Q9HCU8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
POLD4Q9HCU8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
POLD4Q9HCU8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
POLD4Q9HCU8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
POLD4Q9HCU8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
POLD4Q9HCU8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
POLD4Q9HCU8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms