Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC24

TMBIM4, Protein lifeguard 4, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMBIM4Q9HC24 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMBIM4Q9HC24 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TMBIM4Q9HC24 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TMBIM4Q9HC24 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
TMBIM4Q9HC24 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMBIM4Q9HC24 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMBIM4Q9HC24 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMBIM4Q9HC24 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMBIM4Q9HC24 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMBIM4Q9HC24 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMBIM4Q9HC24 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMBIM4Q9HC24 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMBIM4Q9HC24 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMBIM4Q9HC24 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMBIM4Q9HC24 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMBIM4Q9HC24 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMBIM4Q9HC24 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMBIM4Q9HC24 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMBIM4Q9HC24 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMBIM4Q9HC24 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMBIM4Q9HC24 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMBIM4Q9HC24 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMBIM4Q9HC24 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMBIM4Q9HC24 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMBIM4Q9HC24 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMBIM4Q9HC24 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMBIM4Q9HC24 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMBIM4Q9HC24 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMBIM4Q9HC24 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMBIM4Q9HC24 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMBIM4Q9HC24 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMBIM4Q9HC24 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
TMBIM4Q9HC24 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
TMBIM4Q9HC24 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TMBIM4Q9HC24 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TMBIM4Q9HC24 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TMBIM4Q9HC24 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMBIM4Q9HC24 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMBIM4Q9HC24 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TMBIM4Q9HC24 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TMBIM4Q9HC24 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.51■■■□□ 2
TMBIM4Q9HC24 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMBIM4Q9HC24 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMBIM4Q9HC24 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMBIM4Q9HC24 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMBIM4Q9HC24 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMBIM4Q9HC24 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMBIM4Q9HC24 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMBIM4Q9HC24 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMBIM4Q9HC24 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMBIM4Q9HC24 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMBIM4Q9HC24 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TMBIM4Q9HC24 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMBIM4Q9HC24 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMBIM4Q9HC24 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMBIM4Q9HC24 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMBIM4Q9HC24 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMBIM4Q9HC24 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMBIM4Q9HC24 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMBIM4Q9HC24 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMBIM4Q9HC24 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMBIM4Q9HC24 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMBIM4Q9HC24 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMBIM4Q9HC24 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMBIM4Q9HC24 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TMBIM4Q9HC24 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMBIM4Q9HC24 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMBIM4Q9HC24 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMBIM4Q9HC24 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMBIM4Q9HC24 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMBIM4Q9HC24 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMBIM4Q9HC24 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMBIM4Q9HC24 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMBIM4Q9HC24 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMBIM4Q9HC24 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMBIM4Q9HC24 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMBIM4Q9HC24 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMBIM4Q9HC24 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMBIM4Q9HC24 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMBIM4Q9HC24 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMBIM4Q9HC24 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMBIM4Q9HC24 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMBIM4Q9HC24 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMBIM4Q9HC24 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMBIM4Q9HC24 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMBIM4Q9HC24 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMBIM4Q9HC24 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMBIM4Q9HC24 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMBIM4Q9HC24 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMBIM4Q9HC24 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMBIM4Q9HC24 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMBIM4Q9HC24 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
TMBIM4Q9HC24 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMBIM4Q9HC24 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMBIM4Q9HC24 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMBIM4Q9HC24 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMBIM4Q9HC24 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMBIM4Q9HC24 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMBIM4Q9HC24 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMBIM4Q9HC24 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.1 ms