Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB8

PPCS, Phosphopantothenate--cysteine ligase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPCSQ9HAB8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PPCSQ9HAB8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PPCSQ9HAB8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PPCSQ9HAB8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PPCSQ9HAB8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PPCSQ9HAB8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PPCSQ9HAB8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PPCSQ9HAB8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PPCSQ9HAB8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PPCSQ9HAB8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PPCSQ9HAB8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPCSQ9HAB8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPCSQ9HAB8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPCSQ9HAB8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPCSQ9HAB8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPCSQ9HAB8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPCSQ9HAB8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPCSQ9HAB8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPCSQ9HAB8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPCSQ9HAB8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPCSQ9HAB8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PPCSQ9HAB8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PPCSQ9HAB8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PPCSQ9HAB8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PPCSQ9HAB8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PPCSQ9HAB8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PPCSQ9HAB8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PPCSQ9HAB8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PPCSQ9HAB8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PPCSQ9HAB8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PPCSQ9HAB8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PPCSQ9HAB8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PPCSQ9HAB8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PPCSQ9HAB8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PPCSQ9HAB8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PPCSQ9HAB8 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PPCSQ9HAB8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PPCSQ9HAB8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PPCSQ9HAB8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PPCSQ9HAB8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PPCSQ9HAB8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PPCSQ9HAB8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PPCSQ9HAB8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PPCSQ9HAB8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PPCSQ9HAB8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PPCSQ9HAB8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PPCSQ9HAB8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PPCSQ9HAB8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PPCSQ9HAB8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PPCSQ9HAB8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PPCSQ9HAB8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PPCSQ9HAB8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PPCSQ9HAB8 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PPCSQ9HAB8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PPCSQ9HAB8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PPCSQ9HAB8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PPCSQ9HAB8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PPCSQ9HAB8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PPCSQ9HAB8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PPCSQ9HAB8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PPCSQ9HAB8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.08■■□□□ 1.92
PPCSQ9HAB8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PPCSQ9HAB8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPCSQ9HAB8 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPCSQ9HAB8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PPCSQ9HAB8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PPCSQ9HAB8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PPCSQ9HAB8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPCSQ9HAB8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPCSQ9HAB8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPCSQ9HAB8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PPCSQ9HAB8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PPCSQ9HAB8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PPCSQ9HAB8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PPCSQ9HAB8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PPCSQ9HAB8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PPCSQ9HAB8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PPCSQ9HAB8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PPCSQ9HAB8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PPCSQ9HAB8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PPCSQ9HAB8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PPCSQ9HAB8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PPCSQ9HAB8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PPCSQ9HAB8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PPCSQ9HAB8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PPCSQ9HAB8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PPCSQ9HAB8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PPCSQ9HAB8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PPCSQ9HAB8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PPCSQ9HAB8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PPCSQ9HAB8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PPCSQ9HAB8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PPCSQ9HAB8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PPCSQ9HAB8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PPCSQ9HAB8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PPCSQ9HAB8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PPCSQ9HAB8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PPCSQ9HAB8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PPCSQ9HAB8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PPCSQ9HAB8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms