Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9S5

FKRP, Fukutin-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FKRPQ9H9S5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FKRPQ9H9S5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FKRPQ9H9S5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FKRPQ9H9S5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FKRPQ9H9S5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FKRPQ9H9S5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FKRPQ9H9S5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FKRPQ9H9S5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FKRPQ9H9S5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FKRPQ9H9S5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FKRPQ9H9S5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FKRPQ9H9S5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FKRPQ9H9S5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FKRPQ9H9S5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FKRPQ9H9S5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
FKRPQ9H9S5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FKRPQ9H9S5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FKRPQ9H9S5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FKRPQ9H9S5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FKRPQ9H9S5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FKRPQ9H9S5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FKRPQ9H9S5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FKRPQ9H9S5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FKRPQ9H9S5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FKRPQ9H9S5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FKRPQ9H9S5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FKRPQ9H9S5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FKRPQ9H9S5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FKRPQ9H9S5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FKRPQ9H9S5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FKRPQ9H9S5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FKRPQ9H9S5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FKRPQ9H9S5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FKRPQ9H9S5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FKRPQ9H9S5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FKRPQ9H9S5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FKRPQ9H9S5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FKRPQ9H9S5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FKRPQ9H9S5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FKRPQ9H9S5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FKRPQ9H9S5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FKRPQ9H9S5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FKRPQ9H9S5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FKRPQ9H9S5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
FKRPQ9H9S5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FKRPQ9H9S5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FKRPQ9H9S5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FKRPQ9H9S5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FKRPQ9H9S5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FKRPQ9H9S5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FKRPQ9H9S5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FKRPQ9H9S5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FKRPQ9H9S5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FKRPQ9H9S5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FKRPQ9H9S5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FKRPQ9H9S5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FKRPQ9H9S5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FKRPQ9H9S5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FKRPQ9H9S5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FKRPQ9H9S5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FKRPQ9H9S5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FKRPQ9H9S5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FKRPQ9H9S5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FKRPQ9H9S5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FKRPQ9H9S5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FKRPQ9H9S5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FKRPQ9H9S5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FKRPQ9H9S5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FKRPQ9H9S5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FKRPQ9H9S5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FKRPQ9H9S5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FKRPQ9H9S5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FKRPQ9H9S5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FKRPQ9H9S5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FKRPQ9H9S5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
FKRPQ9H9S5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
FKRPQ9H9S5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FKRPQ9H9S5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FKRPQ9H9S5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FKRPQ9H9S5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FKRPQ9H9S5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FKRPQ9H9S5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FKRPQ9H9S5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FKRPQ9H9S5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FKRPQ9H9S5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FKRPQ9H9S5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FKRPQ9H9S5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FKRPQ9H9S5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FKRPQ9H9S5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FKRPQ9H9S5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FKRPQ9H9S5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FKRPQ9H9S5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FKRPQ9H9S5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FKRPQ9H9S5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FKRPQ9H9S5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FKRPQ9H9S5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FKRPQ9H9S5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
FKRPQ9H9S5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FKRPQ9H9S5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FKRPQ9H9S5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms