Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9S4

CAB39L, Calcium-binding protein 39-like, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39LQ9H9S4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAB39LQ9H9S4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAB39LQ9H9S4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAB39LQ9H9S4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CAB39LQ9H9S4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CAB39LQ9H9S4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CAB39LQ9H9S4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAB39LQ9H9S4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAB39LQ9H9S4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CAB39LQ9H9S4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CAB39LQ9H9S4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CAB39LQ9H9S4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CAB39LQ9H9S4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CAB39LQ9H9S4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CAB39LQ9H9S4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CAB39LQ9H9S4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CAB39LQ9H9S4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CAB39LQ9H9S4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CAB39LQ9H9S4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CAB39LQ9H9S4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CAB39LQ9H9S4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CAB39LQ9H9S4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CAB39LQ9H9S4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CAB39LQ9H9S4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CAB39LQ9H9S4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CAB39LQ9H9S4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CAB39LQ9H9S4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CAB39LQ9H9S4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CAB39LQ9H9S4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CAB39LQ9H9S4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CAB39LQ9H9S4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CAB39LQ9H9S4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CAB39LQ9H9S4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CAB39LQ9H9S4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CAB39LQ9H9S4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CAB39LQ9H9S4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CAB39LQ9H9S4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CAB39LQ9H9S4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CAB39LQ9H9S4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CAB39LQ9H9S4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CAB39LQ9H9S4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CAB39LQ9H9S4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CAB39LQ9H9S4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CAB39LQ9H9S4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CAB39LQ9H9S4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CAB39LQ9H9S4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CAB39LQ9H9S4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CAB39LQ9H9S4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAB39LQ9H9S4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAB39LQ9H9S4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAB39LQ9H9S4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAB39LQ9H9S4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAB39LQ9H9S4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAB39LQ9H9S4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAB39LQ9H9S4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAB39LQ9H9S4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAB39LQ9H9S4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAB39LQ9H9S4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CAB39LQ9H9S4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CAB39LQ9H9S4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CAB39LQ9H9S4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CAB39LQ9H9S4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CAB39LQ9H9S4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CAB39LQ9H9S4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CAB39LQ9H9S4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CAB39LQ9H9S4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CAB39LQ9H9S4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CAB39LQ9H9S4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CAB39LQ9H9S4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CAB39LQ9H9S4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CAB39LQ9H9S4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CAB39LQ9H9S4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CAB39LQ9H9S4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CAB39LQ9H9S4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CAB39LQ9H9S4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CAB39LQ9H9S4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CAB39LQ9H9S4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CAB39LQ9H9S4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CAB39LQ9H9S4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CAB39LQ9H9S4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CAB39LQ9H9S4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CAB39LQ9H9S4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CAB39LQ9H9S4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CAB39LQ9H9S4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CAB39LQ9H9S4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CAB39LQ9H9S4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CAB39LQ9H9S4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CAB39LQ9H9S4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CAB39LQ9H9S4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CAB39LQ9H9S4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CAB39LQ9H9S4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CAB39LQ9H9S4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CAB39LQ9H9S4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CAB39LQ9H9S4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CAB39LQ9H9S4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CAB39LQ9H9S4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAB39LQ9H9S4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAB39LQ9H9S4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAB39LQ9H9S4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CAB39LQ9H9S4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms