Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8V3

ECT2, Protein ECT2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECT2Q9H8V3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ECT2Q9H8V3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ECT2Q9H8V3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ECT2Q9H8V3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ECT2Q9H8V3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ECT2Q9H8V3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ECT2Q9H8V3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ECT2Q9H8V3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ECT2Q9H8V3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ECT2Q9H8V3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ECT2Q9H8V3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ECT2Q9H8V3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ECT2Q9H8V3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ECT2Q9H8V3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ECT2Q9H8V3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ECT2Q9H8V3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ECT2Q9H8V3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ECT2Q9H8V3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ECT2Q9H8V3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ECT2Q9H8V3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ECT2Q9H8V3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ECT2Q9H8V3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ECT2Q9H8V3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ECT2Q9H8V3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ECT2Q9H8V3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
ECT2Q9H8V3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ECT2Q9H8V3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ECT2Q9H8V3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ECT2Q9H8V3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ECT2Q9H8V3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ECT2Q9H8V3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ECT2Q9H8V3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ECT2Q9H8V3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ECT2Q9H8V3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ECT2Q9H8V3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ECT2Q9H8V3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
ECT2Q9H8V3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ECT2Q9H8V3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ECT2Q9H8V3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ECT2Q9H8V3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
ECT2Q9H8V3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ECT2Q9H8V3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ECT2Q9H8V3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ECT2Q9H8V3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ECT2Q9H8V3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ECT2Q9H8V3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ECT2Q9H8V3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ECT2Q9H8V3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ECT2Q9H8V3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ECT2Q9H8V3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ECT2Q9H8V3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ECT2Q9H8V3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ECT2Q9H8V3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ECT2Q9H8V3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
ECT2Q9H8V3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ECT2Q9H8V3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ECT2Q9H8V3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ECT2Q9H8V3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ECT2Q9H8V3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
ECT2Q9H8V3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ECT2Q9H8V3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ECT2Q9H8V3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ECT2Q9H8V3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ECT2Q9H8V3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ECT2Q9H8V3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ECT2Q9H8V3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ECT2Q9H8V3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ECT2Q9H8V3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ECT2Q9H8V3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ECT2Q9H8V3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
ECT2Q9H8V3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ECT2Q9H8V3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ECT2Q9H8V3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ECT2Q9H8V3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ECT2Q9H8V3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ECT2Q9H8V3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
ECT2Q9H8V3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ECT2Q9H8V3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ECT2Q9H8V3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ECT2Q9H8V3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ECT2Q9H8V3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ECT2Q9H8V3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ECT2Q9H8V3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ECT2Q9H8V3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ECT2Q9H8V3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ECT2Q9H8V3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ECT2Q9H8V3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ECT2Q9H8V3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ECT2Q9H8V3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ECT2Q9H8V3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ECT2Q9H8V3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ECT2Q9H8V3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ECT2Q9H8V3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ECT2Q9H8V3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ECT2Q9H8V3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ECT2Q9H8V3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ECT2Q9H8V3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ECT2Q9H8V3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ECT2Q9H8V3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ECT2Q9H8V3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms