Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8M2

BRD9, Bromodomain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD9Q9H8M2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
BRD9Q9H8M2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
BRD9Q9H8M2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
BRD9Q9H8M2 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
BRD9Q9H8M2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
BRD9Q9H8M2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
BRD9Q9H8M2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
BRD9Q9H8M2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
BRD9Q9H8M2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
BRD9Q9H8M2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
BRD9Q9H8M2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
BRD9Q9H8M2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
BRD9Q9H8M2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
BRD9Q9H8M2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
BRD9Q9H8M2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BRD9Q9H8M2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
BRD9Q9H8M2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
BRD9Q9H8M2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
BRD9Q9H8M2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
BRD9Q9H8M2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BRD9Q9H8M2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
BRD9Q9H8M2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BRD9Q9H8M2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
BRD9Q9H8M2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BRD9Q9H8M2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
BRD9Q9H8M2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
BRD9Q9H8M2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
BRD9Q9H8M2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
BRD9Q9H8M2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
BRD9Q9H8M2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BRD9Q9H8M2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
BRD9Q9H8M2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
BRD9Q9H8M2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
BRD9Q9H8M2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
BRD9Q9H8M2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BRD9Q9H8M2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
BRD9Q9H8M2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
BRD9Q9H8M2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
BRD9Q9H8M2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
BRD9Q9H8M2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
BRD9Q9H8M2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BRD9Q9H8M2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
BRD9Q9H8M2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BRD9Q9H8M2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BRD9Q9H8M2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BRD9Q9H8M2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BRD9Q9H8M2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BRD9Q9H8M2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BRD9Q9H8M2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BRD9Q9H8M2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BRD9Q9H8M2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
BRD9Q9H8M2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BRD9Q9H8M2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BRD9Q9H8M2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BRD9Q9H8M2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BRD9Q9H8M2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BRD9Q9H8M2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BRD9Q9H8M2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BRD9Q9H8M2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
BRD9Q9H8M2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BRD9Q9H8M2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
BRD9Q9H8M2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BRD9Q9H8M2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRD9Q9H8M2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRD9Q9H8M2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRD9Q9H8M2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BRD9Q9H8M2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
BRD9Q9H8M2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
BRD9Q9H8M2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
BRD9Q9H8M2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BRD9Q9H8M2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BRD9Q9H8M2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BRD9Q9H8M2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRD9Q9H8M2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRD9Q9H8M2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRD9Q9H8M2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRD9Q9H8M2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRD9Q9H8M2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRD9Q9H8M2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BRD9Q9H8M2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
BRD9Q9H8M2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
BRD9Q9H8M2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BRD9Q9H8M2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRD9Q9H8M2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRD9Q9H8M2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRD9Q9H8M2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BRD9Q9H8M2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BRD9Q9H8M2 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BRD9Q9H8M2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
BRD9Q9H8M2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRD9Q9H8M2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
BRD9Q9H8M2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
BRD9Q9H8M2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
BRD9Q9H8M2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRD9Q9H8M2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BRD9Q9H8M2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BRD9Q9H8M2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRD9Q9H8M2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRD9Q9H8M2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRD9Q9H8M2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.6 ms