Protein–RNA interactions for Protein: Q9H816

DCLRE1B, 5' exonuclease Apollo, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1BQ9H816 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DCLRE1BQ9H816 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DCLRE1BQ9H816 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DCLRE1BQ9H816 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DCLRE1BQ9H816 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DCLRE1BQ9H816 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DCLRE1BQ9H816 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DCLRE1BQ9H816 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DCLRE1BQ9H816 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
DCLRE1BQ9H816 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DCLRE1BQ9H816 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DCLRE1BQ9H816 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DCLRE1BQ9H816 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DCLRE1BQ9H816 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DCLRE1BQ9H816 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DCLRE1BQ9H816 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DCLRE1BQ9H816 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DCLRE1BQ9H816 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DCLRE1BQ9H816 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DCLRE1BQ9H816 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DCLRE1BQ9H816 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DCLRE1BQ9H816 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DCLRE1BQ9H816 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DCLRE1BQ9H816 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DCLRE1BQ9H816 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DCLRE1BQ9H816 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DCLRE1BQ9H816 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DCLRE1BQ9H816 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DCLRE1BQ9H816 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DCLRE1BQ9H816 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DCLRE1BQ9H816 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DCLRE1BQ9H816 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DCLRE1BQ9H816 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DCLRE1BQ9H816 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DCLRE1BQ9H816 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DCLRE1BQ9H816 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DCLRE1BQ9H816 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
DCLRE1BQ9H816 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DCLRE1BQ9H816 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DCLRE1BQ9H816 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DCLRE1BQ9H816 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DCLRE1BQ9H816 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DCLRE1BQ9H816 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DCLRE1BQ9H816 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
DCLRE1BQ9H816 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DCLRE1BQ9H816 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DCLRE1BQ9H816 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DCLRE1BQ9H816 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DCLRE1BQ9H816 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DCLRE1BQ9H816 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DCLRE1BQ9H816 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DCLRE1BQ9H816 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DCLRE1BQ9H816 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DCLRE1BQ9H816 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DCLRE1BQ9H816 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
DCLRE1BQ9H816 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
DCLRE1BQ9H816 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DCLRE1BQ9H816 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DCLRE1BQ9H816 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DCLRE1BQ9H816 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DCLRE1BQ9H816 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DCLRE1BQ9H816 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DCLRE1BQ9H816 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DCLRE1BQ9H816 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DCLRE1BQ9H816 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DCLRE1BQ9H816 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DCLRE1BQ9H816 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DCLRE1BQ9H816 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DCLRE1BQ9H816 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DCLRE1BQ9H816 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DCLRE1BQ9H816 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DCLRE1BQ9H816 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DCLRE1BQ9H816 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DCLRE1BQ9H816 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DCLRE1BQ9H816 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DCLRE1BQ9H816 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DCLRE1BQ9H816 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DCLRE1BQ9H816 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DCLRE1BQ9H816 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DCLRE1BQ9H816 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DCLRE1BQ9H816 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DCLRE1BQ9H816 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DCLRE1BQ9H816 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DCLRE1BQ9H816 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DCLRE1BQ9H816 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DCLRE1BQ9H816 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DCLRE1BQ9H816 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DCLRE1BQ9H816 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DCLRE1BQ9H816 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DCLRE1BQ9H816 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DCLRE1BQ9H816 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DCLRE1BQ9H816 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DCLRE1BQ9H816 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DCLRE1BQ9H816 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DCLRE1BQ9H816 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DCLRE1BQ9H816 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DCLRE1BQ9H816 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DCLRE1BQ9H816 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DCLRE1BQ9H816 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DCLRE1BQ9H816 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms