Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLMPQ9H6B4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLMPQ9H6B4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLMPQ9H6B4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLMPQ9H6B4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLMPQ9H6B4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CLMPQ9H6B4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CLMPQ9H6B4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLMPQ9H6B4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLMPQ9H6B4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLMPQ9H6B4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLMPQ9H6B4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CLMPQ9H6B4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLMPQ9H6B4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CLMPQ9H6B4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLMPQ9H6B4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLMPQ9H6B4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLMPQ9H6B4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLMPQ9H6B4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLMPQ9H6B4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLMPQ9H6B4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLMPQ9H6B4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLMPQ9H6B4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CLMPQ9H6B4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLMPQ9H6B4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLMPQ9H6B4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLMPQ9H6B4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CLMPQ9H6B4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CLMPQ9H6B4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLMPQ9H6B4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLMPQ9H6B4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLMPQ9H6B4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLMPQ9H6B4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLMPQ9H6B4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLMPQ9H6B4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLMPQ9H6B4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLMPQ9H6B4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLMPQ9H6B4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLMPQ9H6B4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CLMPQ9H6B4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CLMPQ9H6B4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CLMPQ9H6B4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CLMPQ9H6B4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLMPQ9H6B4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLMPQ9H6B4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLMPQ9H6B4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLMPQ9H6B4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLMPQ9H6B4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLMPQ9H6B4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CLMPQ9H6B4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CLMPQ9H6B4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLMPQ9H6B4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLMPQ9H6B4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLMPQ9H6B4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLMPQ9H6B4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLMPQ9H6B4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLMPQ9H6B4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLMPQ9H6B4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLMPQ9H6B4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLMPQ9H6B4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLMPQ9H6B4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLMPQ9H6B4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLMPQ9H6B4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLMPQ9H6B4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLMPQ9H6B4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLMPQ9H6B4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLMPQ9H6B4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLMPQ9H6B4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLMPQ9H6B4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLMPQ9H6B4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLMPQ9H6B4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLMPQ9H6B4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLMPQ9H6B4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLMPQ9H6B4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLMPQ9H6B4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CLMPQ9H6B4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CLMPQ9H6B4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CLMPQ9H6B4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLMPQ9H6B4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLMPQ9H6B4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLMPQ9H6B4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLMPQ9H6B4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLMPQ9H6B4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLMPQ9H6B4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLMPQ9H6B4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLMPQ9H6B4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLMPQ9H6B4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLMPQ9H6B4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLMPQ9H6B4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLMPQ9H6B4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CLMPQ9H6B4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLMPQ9H6B4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLMPQ9H6B4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLMPQ9H6B4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLMPQ9H6B4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLMPQ9H6B4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLMPQ9H6B4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLMPQ9H6B4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLMPQ9H6B4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLMPQ9H6B4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms