Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q3

PRDM13, PR domain zinc finger protein 13, humanhuman

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Length 707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM13Q9H4Q3 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PRDM13Q9H4Q3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRDM13Q9H4Q3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRDM13Q9H4Q3 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRDM13Q9H4Q3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRDM13Q9H4Q3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRDM13Q9H4Q3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRDM13Q9H4Q3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM13Q9H4Q3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRDM13Q9H4Q3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRDM13Q9H4Q3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRDM13Q9H4Q3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM13Q9H4Q3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM13Q9H4Q3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM13Q9H4Q3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRDM13Q9H4Q3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM13Q9H4Q3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM13Q9H4Q3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM13Q9H4Q3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM13Q9H4Q3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM13Q9H4Q3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM13Q9H4Q3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM13Q9H4Q3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRDM13Q9H4Q3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRDM13Q9H4Q3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRDM13Q9H4Q3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRDM13Q9H4Q3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM13Q9H4Q3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM13Q9H4Q3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM13Q9H4Q3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRDM13Q9H4Q3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRDM13Q9H4Q3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRDM13Q9H4Q3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDM13Q9H4Q3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDM13Q9H4Q3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDM13Q9H4Q3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM13Q9H4Q3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM13Q9H4Q3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM13Q9H4Q3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM13Q9H4Q3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM13Q9H4Q3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM13Q9H4Q3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM13Q9H4Q3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM13Q9H4Q3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM13Q9H4Q3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM13Q9H4Q3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM13Q9H4Q3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDM13Q9H4Q3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDM13Q9H4Q3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDM13Q9H4Q3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM13Q9H4Q3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRDM13Q9H4Q3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM13Q9H4Q3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PRDM13Q9H4Q3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDM13Q9H4Q3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDM13Q9H4Q3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDM13Q9H4Q3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRDM13Q9H4Q3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRDM13Q9H4Q3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRDM13Q9H4Q3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRDM13Q9H4Q3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRDM13Q9H4Q3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRDM13Q9H4Q3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRDM13Q9H4Q3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRDM13Q9H4Q3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRDM13Q9H4Q3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRDM13Q9H4Q3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRDM13Q9H4Q3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PRDM13Q9H4Q3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRDM13Q9H4Q3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRDM13Q9H4Q3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRDM13Q9H4Q3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRDM13Q9H4Q3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRDM13Q9H4Q3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRDM13Q9H4Q3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRDM13Q9H4Q3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRDM13Q9H4Q3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRDM13Q9H4Q3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRDM13Q9H4Q3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRDM13Q9H4Q3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRDM13Q9H4Q3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRDM13Q9H4Q3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRDM13Q9H4Q3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRDM13Q9H4Q3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRDM13Q9H4Q3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRDM13Q9H4Q3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRDM13Q9H4Q3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRDM13Q9H4Q3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PRDM13Q9H4Q3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRDM13Q9H4Q3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRDM13Q9H4Q3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRDM13Q9H4Q3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRDM13Q9H4Q3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRDM13Q9H4Q3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRDM13Q9H4Q3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRDM13Q9H4Q3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRDM13Q9H4Q3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRDM13Q9H4Q3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRDM13Q9H4Q3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRDM13Q9H4Q3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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