Protein–RNA interactions for Protein: Q9H320

VCX, Variable charge X-linked protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCXQ9H320 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VCXQ9H320 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VCXQ9H320 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VCXQ9H320 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VCXQ9H320 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VCXQ9H320 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VCXQ9H320 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VCXQ9H320 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VCXQ9H320 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VCXQ9H320 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VCXQ9H320 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VCXQ9H320 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
VCXQ9H320 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
VCXQ9H320 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
VCXQ9H320 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VCXQ9H320 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VCXQ9H320 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VCXQ9H320 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VCXQ9H320 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VCXQ9H320 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VCXQ9H320 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VCXQ9H320 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VCXQ9H320 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VCXQ9H320 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VCXQ9H320 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VCXQ9H320 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VCXQ9H320 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VCXQ9H320 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VCXQ9H320 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VCXQ9H320 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VCXQ9H320 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VCXQ9H320 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
VCXQ9H320 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VCXQ9H320 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VCXQ9H320 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VCXQ9H320 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VCXQ9H320 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VCXQ9H320 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VCXQ9H320 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VCXQ9H320 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
VCXQ9H320 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VCXQ9H320 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VCXQ9H320 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VCXQ9H320 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VCXQ9H320 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
VCXQ9H320 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VCXQ9H320 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VCXQ9H320 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VCXQ9H320 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VCXQ9H320 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VCXQ9H320 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VCXQ9H320 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VCXQ9H320 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VCXQ9H320 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VCXQ9H320 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VCXQ9H320 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VCXQ9H320 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VCXQ9H320 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VCXQ9H320 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VCXQ9H320 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VCXQ9H320 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VCXQ9H320 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VCXQ9H320 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VCXQ9H320 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VCXQ9H320 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
VCXQ9H320 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
VCXQ9H320 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VCXQ9H320 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VCXQ9H320 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VCXQ9H320 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VCXQ9H320 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VCXQ9H320 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VCXQ9H320 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VCXQ9H320 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VCXQ9H320 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VCXQ9H320 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VCXQ9H320 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VCXQ9H320 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VCXQ9H320 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
VCXQ9H320 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VCXQ9H320 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VCXQ9H320 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VCXQ9H320 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VCXQ9H320 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VCXQ9H320 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VCXQ9H320 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VCXQ9H320 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VCXQ9H320 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VCXQ9H320 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VCXQ9H320 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VCXQ9H320 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
VCXQ9H320 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VCXQ9H320 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VCXQ9H320 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VCXQ9H320 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VCXQ9H320 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VCXQ9H320 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VCXQ9H320 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VCXQ9H320 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VCXQ9H320 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms