Protein–RNA interactions for Protein: Q9H201

EPN3, Epsin-3, humanhuman

Predictions only

Length 632 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPN3Q9H201 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
EPN3Q9H201 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
EPN3Q9H201 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
EPN3Q9H201 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
EPN3Q9H201 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
EPN3Q9H201 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
EPN3Q9H201 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
EPN3Q9H201 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
EPN3Q9H201 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
EPN3Q9H201 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EPN3Q9H201 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EPN3Q9H201 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
EPN3Q9H201 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
EPN3Q9H201 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
EPN3Q9H201 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EPN3Q9H201 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EPN3Q9H201 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EPN3Q9H201 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
EPN3Q9H201 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EPN3Q9H201 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EPN3Q9H201 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EPN3Q9H201 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EPN3Q9H201 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
EPN3Q9H201 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EPN3Q9H201 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EPN3Q9H201 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
EPN3Q9H201 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
EPN3Q9H201 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
EPN3Q9H201 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
EPN3Q9H201 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EPN3Q9H201 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EPN3Q9H201 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EPN3Q9H201 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EPN3Q9H201 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EPN3Q9H201 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EPN3Q9H201 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EPN3Q9H201 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
EPN3Q9H201 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EPN3Q9H201 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
EPN3Q9H201 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
EPN3Q9H201 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
EPN3Q9H201 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
EPN3Q9H201 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
EPN3Q9H201 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
EPN3Q9H201 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EPN3Q9H201 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
EPN3Q9H201 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EPN3Q9H201 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EPN3Q9H201 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
EPN3Q9H201 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EPN3Q9H201 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EPN3Q9H201 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
EPN3Q9H201 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EPN3Q9H201 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
EPN3Q9H201 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
EPN3Q9H201 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EPN3Q9H201 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EPN3Q9H201 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EPN3Q9H201 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EPN3Q9H201 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EPN3Q9H201 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
EPN3Q9H201 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
EPN3Q9H201 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
EPN3Q9H201 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
EPN3Q9H201 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
EPN3Q9H201 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
EPN3Q9H201 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
EPN3Q9H201 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EPN3Q9H201 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
EPN3Q9H201 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EPN3Q9H201 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EPN3Q9H201 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
EPN3Q9H201 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
EPN3Q9H201 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
EPN3Q9H201 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
EPN3Q9H201 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EPN3Q9H201 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
EPN3Q9H201 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
EPN3Q9H201 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
EPN3Q9H201 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
EPN3Q9H201 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EPN3Q9H201 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EPN3Q9H201 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
EPN3Q9H201 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
EPN3Q9H201 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
EPN3Q9H201 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
EPN3Q9H201 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
EPN3Q9H201 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EPN3Q9H201 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
EPN3Q9H201 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
EPN3Q9H201 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
EPN3Q9H201 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
EPN3Q9H201 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
EPN3Q9H201 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
EPN3Q9H201 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
EPN3Q9H201 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
EPN3Q9H201 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EPN3Q9H201 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EPN3Q9H201 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
EPN3Q9H201 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms