Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM8

NDEL1, Nuclear distribution protein nudE-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDEL1Q9GZM8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NDEL1Q9GZM8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NDEL1Q9GZM8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NDEL1Q9GZM8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NDEL1Q9GZM8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NDEL1Q9GZM8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NDEL1Q9GZM8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NDEL1Q9GZM8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NDEL1Q9GZM8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NDEL1Q9GZM8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NDEL1Q9GZM8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NDEL1Q9GZM8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NDEL1Q9GZM8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NDEL1Q9GZM8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NDEL1Q9GZM8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NDEL1Q9GZM8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NDEL1Q9GZM8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NDEL1Q9GZM8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NDEL1Q9GZM8 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NDEL1Q9GZM8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NDEL1Q9GZM8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NDEL1Q9GZM8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NDEL1Q9GZM8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NDEL1Q9GZM8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NDEL1Q9GZM8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NDEL1Q9GZM8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NDEL1Q9GZM8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NDEL1Q9GZM8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NDEL1Q9GZM8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NDEL1Q9GZM8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NDEL1Q9GZM8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NDEL1Q9GZM8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NDEL1Q9GZM8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NDEL1Q9GZM8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NDEL1Q9GZM8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NDEL1Q9GZM8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NDEL1Q9GZM8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NDEL1Q9GZM8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NDEL1Q9GZM8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NDEL1Q9GZM8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NDEL1Q9GZM8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NDEL1Q9GZM8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NDEL1Q9GZM8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NDEL1Q9GZM8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NDEL1Q9GZM8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NDEL1Q9GZM8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NDEL1Q9GZM8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NDEL1Q9GZM8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NDEL1Q9GZM8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NDEL1Q9GZM8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NDEL1Q9GZM8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NDEL1Q9GZM8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NDEL1Q9GZM8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NDEL1Q9GZM8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NDEL1Q9GZM8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NDEL1Q9GZM8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NDEL1Q9GZM8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NDEL1Q9GZM8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NDEL1Q9GZM8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NDEL1Q9GZM8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NDEL1Q9GZM8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NDEL1Q9GZM8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NDEL1Q9GZM8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NDEL1Q9GZM8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NDEL1Q9GZM8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NDEL1Q9GZM8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NDEL1Q9GZM8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NDEL1Q9GZM8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NDEL1Q9GZM8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NDEL1Q9GZM8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NDEL1Q9GZM8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NDEL1Q9GZM8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NDEL1Q9GZM8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NDEL1Q9GZM8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NDEL1Q9GZM8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NDEL1Q9GZM8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NDEL1Q9GZM8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NDEL1Q9GZM8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NDEL1Q9GZM8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NDEL1Q9GZM8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NDEL1Q9GZM8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDEL1Q9GZM8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NDEL1Q9GZM8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NDEL1Q9GZM8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NDEL1Q9GZM8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NDEL1Q9GZM8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NDEL1Q9GZM8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NDEL1Q9GZM8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NDEL1Q9GZM8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NDEL1Q9GZM8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NDEL1Q9GZM8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NDEL1Q9GZM8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NDEL1Q9GZM8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NDEL1Q9GZM8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NDEL1Q9GZM8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NDEL1Q9GZM8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NDEL1Q9GZM8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NDEL1Q9GZM8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NDEL1Q9GZM8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NDEL1Q9GZM8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms