Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER74

Sall1, Sal-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall1Q9ER74 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Sall1Q9ER74 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Sall1Q9ER74 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Sall1Q9ER74 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Sall1Q9ER74 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Sall1Q9ER74 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Sall1Q9ER74 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Sall1Q9ER74 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Sall1Q9ER74 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Sall1Q9ER74 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Sall1Q9ER74 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Sall1Q9ER74 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Sall1Q9ER74 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Sall1Q9ER74 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Sall1Q9ER74 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Sall1Q9ER74 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Sall1Q9ER74 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Sall1Q9ER74 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Sall1Q9ER74 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Sall1Q9ER74 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Sall1Q9ER74 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Sall1Q9ER74 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Sall1Q9ER74 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Sall1Q9ER74 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Sall1Q9ER74 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Sall1Q9ER74 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Sall1Q9ER74 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Sall1Q9ER74 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Sall1Q9ER74 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Sall1Q9ER74 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Sall1Q9ER74 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Sall1Q9ER74 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Sall1Q9ER74 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Sall1Q9ER74 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Sall1Q9ER74 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Sall1Q9ER74 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Sall1Q9ER74 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Sall1Q9ER74 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Sall1Q9ER74 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Sall1Q9ER74 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Sall1Q9ER74 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Sall1Q9ER74 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Sall1Q9ER74 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Sall1Q9ER74 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Sall1Q9ER74 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Sall1Q9ER74 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Sall1Q9ER74 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Sall1Q9ER74 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Sall1Q9ER74 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Sall1Q9ER74 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Sall1Q9ER74 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Sall1Q9ER74 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Sall1Q9ER74 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Sall1Q9ER74 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Sall1Q9ER74 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Sall1Q9ER74 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Sall1Q9ER74 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Sall1Q9ER74 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Sall1Q9ER74 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Sall1Q9ER74 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Sall1Q9ER74 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Sall1Q9ER74 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Sall1Q9ER74 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Sall1Q9ER74 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Sall1Q9ER74 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Sall1Q9ER74 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Sall1Q9ER74 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Sall1Q9ER74 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Sall1Q9ER74 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Sall1Q9ER74 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Sall1Q9ER74 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Sall1Q9ER74 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Sall1Q9ER74 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Sall1Q9ER74 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Sall1Q9ER74 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Sall1Q9ER74 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Sall1Q9ER74 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Sall1Q9ER74 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Sall1Q9ER74 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Sall1Q9ER74 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Sall1Q9ER74 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Sall1Q9ER74 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Sall1Q9ER74 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Sall1Q9ER74 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Sall1Q9ER74 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Sall1Q9ER74 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Sall1Q9ER74 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Sall1Q9ER74 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Sall1Q9ER74 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Sall1Q9ER74 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Sall1Q9ER74 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Sall1Q9ER74 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Sall1Q9ER74 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Sall1Q9ER74 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Sall1Q9ER74 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Sall1Q9ER74 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Sall1Q9ER74 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Sall1Q9ER74 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Sall1Q9ER74 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Sall1Q9ER74 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms